Bakalářská práce

Vývoj nástrojů pro identifikaci nových interakčních partnerů N-terminální části RECQ4 proteinu

Developing tools for identification novel interaction partners of N-terminus of RECQ4 protein

Volha Maroz, učo 479465
Anotace

RECQ4 je DNA helikáza, která se podílí na udržování genomové stability v celé řadě organismů včetně lidského a hraje důležitou roli v DNA replikaci, opravách DNA poškození a dalších procesech. Nicméně, funkce RECQ4 v těchto drahách a interakce s dalšími partnery nejsou dostatečně popsány. Zde navrhuji metodu proximálního značení k identifikaci nových RECQ4 interakčních partnerů (proteinů, ale i nukleových …více

Abstract

RECQ4 is a DNA helicase that is involved in maintaining genomic stability in a range of organisms, including humans. Specifically, it plays an important role in DNA replication and DNA damage repair. However, the functions of RECQ4 in these pathways and its interactions with other proteins are not satisfactorily described. Here, I propose a proximity labeling approach to identify new RECQ4 interaction …více

Klíčová slova
RECQ4 REC helikázy APEX2 proximální značení G-kvadruplexy RECQ helicases proximity labeling G-quadruplexes
Zadání práce

RECQ4 is a member of the RECQ family of helicases. Similarly to other RECQ members, RECQ4 is important for DNA repair and genome stability. Consistently, mutations in this gene lead to severe genetic diseases in humans, namely Rothmund-Thomson, RAPADILINO, and Baller-Gerold syndromes. RECQ4 is unique among RECQ helicases since it contains an essential N-terminal region that is partially homologous to the yeast SLD2 protein. Like SLD2, it is involved in the initiation of DNA replication, and additionally, the RECQ4 N-terminus has been shown to interact with various DNA substrates and DNA repair proteins. Despite that, the specific molecular functions of RECQ4 are still largely unknown.

This bachelor project aims to develop the necessary tools to describe the interaction networks of the RECQ4 N-terminus in vivo. Ultimately, this should help us to understand the different cellular contexts/pathways in which RECQ4 contributes to DNA repair and genome integrity.

Administrativní informace
Práce zkontrolována:
18. 5. 2023 16:14, doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D., učo 18098
Plný text práce
939 KB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
5. 6. 2023
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D., učo 18098
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Zdenka Hašanová, Ph.D.
PRNA CSB CEITEC MU

Konzultant

Mgr. Jakub Cibulka, PhD., učo 244150
VSLK BiolÚ Teorie LF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biochemie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.