Závěrečná práce: Kateřina Peterková: NMR studium bázově modifikovaných G-kvadruplexů
Bakalářská práce
NMR studium bázově modifikovaných G-kvadruplexů
NMR study of base-modified G-quadruplexes
Kateřina Peterková
Anotace
Hlavním cílem této bakalářské práce bylo studium nukleotidové sekvence TG3AG3T a bázového analogu s 2 aminoadeninem v pozici pět. Oligonukleotid byl studován pomocí metod nukleární magnetické rezonance, cirkulárního dichroismu a gelové elektroforézy.
Abstract
The main goal of this Bachelor Thesis was the study of the TG3AG3T nucleotide sequence and its base analog with 2 aminoadenine in the position five. The oligonucleotide was studied using methods of nuclear magnetic resonance, circular dichroism and gel electrophoresis.
Klíčová slova
G-kvadruplexy modifikované báze NMR CD A tetrády G-quadruplexes Modified Bases A-tetradZadání práce
V teoretické části práce shrnout základní poznatky o strukturních vlastnostech DNA kvadruplexů a jejich modifikovaných analog.
Pomocí analýzy 1H NMR spekter oligonukleotidů se sekvenčními motivy AGnXA a TGnXGnT, kde X označuje 2-aminoadenin, identifikovat topologii a pomocí sekvenčního přiřazení posoudit vliv substituce.
Práce zkontrolována:
3. 6. 2016 07:11, Mgr. Jan Novotný, Ph.D., učo 176003
3. 6. 2016 07:11, Mgr. Jan Novotný, Ph.D., učo 176003
Jazyk práce
Termín obhajoby
15. 6. 2016
Práce byla úspěšně obhájena
Konzultant
Literatura
- NOVOTNÝ, Jan; Yevgen YURENKO; Petr KULHÁNEK a Radek MAREK. Tailoring the Properties of Quadruplex Nucleobases for Biological and Nanomaterial Applications. Physical Chemistry Chemical Physics. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2014, roč. 16, č. 29, s. 15241-15248. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://doi.org/10.1039/C4CP00541D.
Studijní program
Chemie
Obor
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Characterization of non-B DNA structures using NMR spectroscopy
Ilektra-Chara Giassa, Ph.D. -
MD simulace a NMR studium nekovalentních interakcí: Kvadruplexy a další supramolekulární útvary
Mgr. Martin Novák, Ph.D., učo 323460 -
RNA a DNA kvadruplexy v biologii proteinu p53
Mgr. Tomáš Váchal -
Úloha lokálních struktur nukleových kyselin v patogenezi a stárnutí
Bc. Vojtěch Havlík -
NMR charakterizace C3GAGA DNA sekvence
Mgr. Aleš Novotný -
Vývoj nástrojů pro identifikaci nových interakčních partnerů N-terminální části RECQ4 proteinu
Mgr. Olga Cibulková, učo 479465 -
Bioinformatická analýza G-kvadruplexů v regulačních oblastech cílových genů ΔNp63 a p53 dysregulovaných u spinocelulárních karcinomů
Mgr. Barbora Nekolová -
Transkripční faktory obsahující homeodoménu Hox a jejich interakce s nukleovými kyselinami
Bc. Tomasz Jurczyk
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Složky
Soubory
Peterková, K.
31. 5. 2016
Peterková, K.
31. 5. 2016
9. 6. 2016




