Diplomová práce

Bioinformatická analýza G-kvadruplexů v regulačních oblastech cílových genů ΔNp63 a p53 dysregulovaných u spinocelulárních karcinomů

Bioinformatic Analysis of G-Quadruplexes in Regulatory Regions of ΔNp63 and p53 Target Genes Dysregulated in Squamous Cell Carcinomas

Barbora Nekolová
Anotace

Diplomová práce si klade za cíl provést bioinformatickou analýzu role sekundárních struktur DNA, konkrétně G-kvadruplexů, v regulačních oblastech genů řízených transkripčním faktorem ΔNp63, považovaným za onkogenní protein, případně také nádorovým supresorem p53, u spinocelulárních karcinomů. Praktická část je založena na in silico predikci G-kvadruplexů pomocí algoritmu G4Hunter u 32 vybraných cílových …více

Abstract

This master's thesis aims to perform a bioinformatic analysis on the role of secondary DNA structures, specifically G-quadruplexes, in the regulatory regions of genes controlled by the transcription factor ΔNp63, considered an oncogenic protein, and potentially also by the tumor suppressor p53, in squamous cell carcinomas. The practical part is based on the in silico prediction of G-quadruplexes using …více

Klíčová slova
Bioinformatická analýza Epigenetické modifikace G-kvadruplexy Ligandy G-kvadruplexů Protein ΔNp63 Protein p53 Regulace transkripce Spinocelulární karcinom Spinocelulární karcinom hlavy a krku Bioinformatic analysis Epigenetic modifications G-quadruplex ligands G-quadruplexes Head and neck squamous cell carcinoma Squamous cell carcinoma Transcriptional regulation
Zadání práce
Analýza interakce proteinů rodiny p53 s G-bohatými oblastmi genomu pomocí biochemických a biofyzikálních metod. Studium vliv určitých látek na tuto interakci jak in vitro tak in vivo.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
30. 4. 2026 18:52, Mgr. Marie Brázdová, Ph.D., učo 15579
Plný text práce
2,3 MB / soubor PDF

Upozornění:

Část závěrečné práce byla v souladu s § 47b zákona o vysokých školách skryta z důvodu překážky pro její zveřejnění do 1. 4. 2031.

Odůvodnění: Výsledky budou zveřejněny formou článku v odborném časopise.

Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
21. 5. 2026
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Marie Brázdová, Ph.D., učo 15579
ÚMF Ústavy FaF MU

Oponent

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D., učo 31298
KSUZD FI MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Farmaceutická fakulta
Studijní program
Plán
Farmacie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.