Diplomová práce

Role dlouhých nekódujících RNA v BCR signalizaci u maligních B buněk

The role of long non-coding RNAs in BCR signaling in malignant B cells

Libuše Janská, BA
Anotace

Chronická lymfocytární leukémie je častá B buněčná malignita s vysoce variabilním průběhem. Přestože již bylo odhaleno mnoho mechanismů, které k nemoci přispívají, jako je centrální role signalizace B buněčného receptoru (BCR), stále chybí odpovědi na klíčové otázky ohledně patogeneze nemoci a faktorů, které ovlivňují její klinický průběh. Nedávný výzkum nekódující části genomu odhalil rozsáhlý význam …více

Abstract

Chronic lymphocytic leukemia is a prevalent B-cell malignancy with a variable clinical course. Although many disease-driving mechanisms have been uncovered, including the central role of the B-cell receptor (BCR), many questions about disease pathogenesis and the factors determining the clinical course prevail. Recent research on the non-coding genome has uncovered the expansive role of long non-coding …více

Zadání práce
Aktivace B-buněčného receptoru (BCR) je nejdůležitějším signálem pro vznik a funkce B lymfocytů. Chybná regulace BCR signalizace je charakteristická pro vícero B buněčných malignit, zejména pro chronickou lymfocytární leukémii (CLL). Bylo prokázáno, že krátké ne-kódující RNA tzv. microRNA regulují klíčové proteiny ovlivňující BCR signalizaci. Stále ovšem není známa role dlouhých nekódujících RNA (lncRNA) v této molekulární dráze. Cílem diplomové práce bude studovat úlohu vybrané lncRNA u maligních B lymfocytů se zamřením na možnou úlohu v BCR dráze. Provedli jsme diferenciální analýzu exprese lncRNA v maligních B buňkách (CLL) s relativně nízkou vy vysokou aktivitou BCR, což vedlo k identifikaci kandidátních lncRNA, včetně lncRNA označované jako Lnc-BCR2, která bude předmětem této práce. Použijeme CRISPR-KRAB systém ke snížení exprese této lncRNA a následnou charakterizací BCR signalizace zhodnotíme, zda má vliv na tuto dráhu. Toto bude provedeno metodami využívajícími influx vápníkových iontů, včetně GFP-calcium sensoru vyvinutého naší skupinou. Analýzou RNAseq dat popíšeme geny ovlivněné modulací hladiny lncRNA-BCR2 a budeme hledat další případné biologické procesy ovlivněné její expresí.
Práce zkontrolována:
12. 5. 2023 06:02, prof. MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D., učo 101627
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
28. 6. 2023
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D., učo 101627
MikroIB CMM CEITEC MU

Oponent

prof. Mgr. Lukáš Kubala, Ph.D., učo 7056
Zivoc ÚEB Biol PřF MU

Konzultant

Pedro Faria Zeni, učo 490510
MikroIB CMM CEITEC MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.