Diplomová práce

Virtuální screening s využitím molekulového dokování

Virtual screening using molecular docking

Lukáš Neshyba
Anotace

Diplomová práce se zabývá metodami virtuálního screeningu při návrhu nových léčiv. Hlavním cílem je návrh inhibitorů kinázové domény VEGFR2 typu 2, které inhibují angiogenezi, což se využívá při léčbě vysoce vaskularizovaných nádorů. Nově navržené molekuly byly podrobeny predikci farmakokinetických vlastností a molekulovému dokování na VEGFR2. Nejlepší výsledky z dokování byly následně validovány pomocí molekulové dynamiky pro potvrzení stability vazebné polohy.

Abstract

This thesis deals with virtual screening methods in the design of new drugs. The main objective is to design inhibitors of the VEGFR2 type 2 kinase domain that inhib-it angiogenesis, which is used in the treatment of highly vascularized tumors. The newly designed molecules were subjected to pharmacokinetic property prediction and molecular docking on VEGFR2. The best results from docking were then vali-dated using molecular dynamics to confirm the stability of the binding position.

Klíčová slova
lékový design virtuální screening molekulové dokování molekulová dynamika inhibitor angiogeneze inhibitory kinázových domén VEGFR2 drug design virtual screening molecular docking molecular dynamics angiogenesis inhibitor VEGFR2 kinase domain inhibitors
Zadání práce
Diplomová práce bude zaměřená na hledání potenciálních inhibitorů vybraného enzymu s využitím molekulového dokování. V teoretické části bude vytvořena rešerše na dané téma. V experimentální části budou modelovány struktury potenciálních inhibitorů in silico a porovnány jejich předpokládané vlastnosti pomocí vhodného softwaru.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
3. 12. 2025 10:39, Mgr. Ing. Jiří Václavík, Ph.D., učo 245430
Plný text práce
3 MB / soubor PDF
Přílohy (5)
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
20. 1. 2026
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Ing. Jiří Václavík, Ph.D., učo 245430
ÚPL Ústavy FaF MU

Oponent

Ing. Ondřej Jurček, Ph.D. et Ph.D., učo 239999
ÚPL Ústavy FaF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Farmaceutická fakulta
Studijní program
Plán
Farmacie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Archiv závěrečné práce Lukáš Neshyba FaF M-FARM FarmPrez ikzbi/13
Coufalová, L.
29. 6. 2023
Složky
Soubory
Anotace anglicky annotation_english.txt
Neshyba, L.
28. 11. 2025
Anotace česky annotation.txt
Neshyba, L.
28. 11. 2025
Klíčová slova keywords.txt
Neshyba, L.
28. 11. 2025
Plný text práce dp_Neshyba.pdf
Neshyba, L.
28. 11. 2025
Posudek oponenta posudek_oponenta_Jurcek.pdf
Jurček, O.
14. 1. 2026
Posudek vedoucího - Lukáš Neshyba - Virtuální screening s využitím molekulového dokování posudek_vedouciho_Vaclavik.pdf
Václavík, J.
12. 1. 2026
Příloha Kody_pro_analyzu_MD.pdf
Neshyba, L.
28. 11. 2025
Příloha Kody_pro_dokovani.pdf
Neshyba, L.
28. 11. 2025
Příloha Kody_pro_MD.pdf
Neshyba, L.
28. 11. 2025
Příloha Struktury_sloucenin.pdf
Neshyba, L.
28. 11. 2025
Příloha Tabulky_molekul.pdf
Neshyba, L.
28. 11. 2025
Zpráva o průběhu obhajoby prubeh_obhajoby.pdf
Šmejkal, K.
20. 1. 2026

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.