Bakalářská práce

Vliv energetického substrátu a stresových podmínek na expresi genu p28 u bakterie Acidithiobacillus ferrooxidans

Influence of energy substrate and stress conditions on p28 gene expression in Acidithiobacillus ferrooxidans

Jan Matějíček
Anotace

Rhodanasy jsou enzymy, vyskytující se téměř ve všech organismech od bakterií až po člověka. Jsou to enzymy patřící do skupiny thiosíran:kyanidsulfurtransferas. Jejich základní funkce je štěpení vazby mezi dvěma atomy síry vyskytující se v thiosíranu za tvorby síry a siřičitanu. Jedním z proteinů patřících do skupiny rhodanas je i protein P28. Na základě bioinformatické analýzy byly předběžně navrženy …více

Abstract

Rhodaneses are enzymes occurring in almost all organisms from bacteria to humans. They are enzymes, which belongs to the group of thiosulfate:sulfurtransferases. Their basic function is to cleavage the bond between two sulfur atoms present in thiosulfate to form sulfur and sulfite. One of the proteins is also known as protein P28. Based on bioinformatics, a possible function of the protein P28 has …více

Zadání práce
Metabolismus redukovaných sirných látek u extrémně acidofilních sirných bakterií je do značné míry stále nejasný. Rhodanasy jsou téměř všudypřítomné enzymy, které patří do rodiny thiosíran:kyanidsulfurtransferas, štěpící vazbu mezi dvěma atomy síry vyskytující se v thiosíranu za tvorby síry a siřičitan. Protein P28 je jedinou rhodanasou bakterie Acidithiobacillus ferrooxidans, která obsahuje dvě různé domény; rhodanasovou doménu blízko N–terminálnímu konci a doménu tvořenou ankyrinovými repeticemi blízko C–terminálnímu konci. Kombinací bioinformatické analýzy genomického kontextu proteinu P28 spolu s enzymatickými studiemi rekombinantního proteinu a na základě molekulového modelování byla navržena jeho biologická funkce zodpovědná za regulaci enzymové aktivity při fixaci dusíku, jež je vyvolána pH stresem a dále jeho zapojení do biosyntézy a opravy železo-sirných center. Cílem práce je sledování hladiny transkriptu genu p28 u kultur A. ferrooxidans během růstu na různých substrátech a za stresových podmínek. Získané výsledky přispějí k objasnění skutečné biologické funkce proteinu P28 u této bakterie.
Práce zkontrolována:
16. 5. 2016 11:37, Mgr. Jiří Kučera, Ph.D., učo 67570
Plný text práce
3,6 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
8. 2. 2017
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Jiří Kučera, Ph.D., učo 67570
ÚBioch Chem PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.