Závěrečná práce: Jaroslav Oľha, učo 348646: Calculation of dissociation constants using triangulation methods
Bakalářská práce
Calculation of dissociation constants using triangulation methods
Anotace
Jednou z veľkých výziev súčasného chemoinformatického výskumu je zisťovanie disociačnej konštanty (pKa) molekúl. Hodnoty pKa sú veľmi zaujímavé pre rôzne odvetvia výskumu a predovšetkým pre oblasť vývoja liekov - hodnota pKa molekuly je napríklad jedným z kritérií, ktoré nám umožnia vyradiť nevhodnú molekulu zo zoznamu potenciálnych liekov. Avšak experimentálne meranie disociačnej konštanty je komplikované …více
Abstract
One of the great challenges of present-day chemoinformatics research is prediction of dissociation constants (pKa) of molecules. The values of pKa are very interesting for various fields of research, particularly for the area of drug development - for instance, the value of a molecule’s pKa is one of the criteria that allow us to discard an unfit molecule from a list of potential drug molecules. However …více
Zadání práce
Konkrétní cíle práce jsou:
- Nastudovat pojmy týkající se počítačového zpracování molekul a algoritmů pro výpočet pKa.
- Navrhnout a implementovat software pro práci s disociačními konstantami.
- Otestovat vytvořené nástroje na reálných datech týkajících se malých organických molekul. Porovnat přesnost metodiky využívající Delaunayho triangulaci a metodiky používající vícerozměrnou lineární regresi.
29. 5. 2012 14:17, prof. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D., učo 4056
- Zadáno/změněno 21. 6. 2012 10:11, Eva Drštková
- Záznam založen 26. 4. 2012 08:07, Alena Dvořáková
- Zveřejnit od 21. 5. 2012 09:54, Alena Dvořáková
- Práce převzata 21. 5. 2012 09:54, Alena Dvořáková
Vedoucí
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Studium hormonálních regulací u rostlin pomocí kvantifikace interakce mezi proteiny dvoukomponentního signálního systému
RNDr. Ladislav Dokládal, Ph.D. -
Speciální kvadraturní formule
Bc. Lucie Alexandra Mega -
Implementace metod MGC a OGC pro výpočet parciálních atomových nábojů
Mgr. Šimon Zouvala -
Kvantitativní popis interakcí represoru diferenciace neuronů REST a telomerového proteinu TRF2 - implikace pro vývoj neoperativní léčby nádorů mozku
Mgr. Barbora Mikšátková -
Detection of pathways in large macromolecular structures
RNDr. Ondřej Strnad, Ph.D. -
Využití 40% kyseliny benzoové při nekrektomii u popálenin
MUDr. Zuzana Jelínková, Ph.D., učo 51236 -
Stanovení derivátů kyseliny salicylové v rostlinných materiálech pomocí kapalinové chromatografie
Bc. Zuzana Haukvicová -
Multi-Index Approach for Similarity Searching
RNDr. Martin Kyselák




