Disertační práce

Structural basis of miRNA processing in mammals

Mgr. David Zapletal, učo 408483
Anotace

Dicer je RNase III endoribonukleáza, která produkuje malé RNA v dráhách microRNA (miRNA) a RNA interference (RNAi) u eukaryot. Vysoce konzervovaný savčí Dicer podporuje především dráhu miRNA, která je nezbytnou součástí endogenní genové regulace, avšak je neefektivní při zpracovávání dlouhých dvouvláknových RNA (dsRNA), které jsou typickými substráty v dráze RNAi. Myší oocyty exprimují N terminálně …více

Abstract

Dicer is an RNase III endoribonuclease that produces small RNAs in microRNA (miRNA) and RNA interference (RNAi) pathway in eukaryotes. In mammals, the highly conserved Dicer supports mainly miRNA pathway, which is an essential part of endogenous gene regulation, but is inefficient in processing long double-stranded RNA (dsRNA), which are typical substrates in RNAi pathway. Interestingly, mouse oocytes …více

Zadání práce
The mammalian Dicer is essential for miRNA production but was shown to be generally inefficient in supporting RNAi activity. The evolutionary specialization on miRNA processing demonstrates the importance of a tight endogenous gene regulation, while the lost RNAi activity was complemented by an interferon-based antiviral defense. Interestingly, Mus musculus (mouse) presents a unique case among mammals by expressing two Dicer isoforms: the full-length somatic Dicer (mDicer) and a truncated oocyte-specific variant (mDicerO). Unlike mDicer, mDicerO selects for a broader range of substrates and provides strong RNAi activity, which is essential for mouse oocyte development. However, the mechanisms by which the N-terminal truncation in mDicer reactivates RNAi and enhances long dsRNA processing in mDicerO remain unclear. In this PhD project, we will combine the biochemical and structural approaches (namely cryo-EM) to characterise the mechanism behind the RNAi reactivation.
Práce zkontrolována:
7. 1. 2025 10:17, prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D., učo 19362
Plný text práce
14,3 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
3. 2. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D., učo 19362
NCBR PřF MU

Oponenti

prof. Ing. Vojtěch Spiwok, Ph.D.
ext PřF MU, VŠCHT Praha
doc. Ing. Václav Veverka, Ph.D.
ext PřF MU, ÚOCHB AV ČR

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.