Bakalářská práce

Detection and Quantification of Tunneling Nanotubes in Multidimensional Bioimage Data

Bc. Jakub Rádl, učo 521144
Anotace

Tunelující nanotubuly (TNT) jsou úzké, dlouhé struktury propojující buňky, které jim umožňují výměnu informací, molekul, či organel. V posledních dvou desetiletích byly předmětem biologického výzkumu, jelikož se předpokládá, že jsou součástí nejrůznějších fyziologických procesů. Tato práce představuje metodu detekce a kvantifikace tunelujících nanotubulů ve vícerozměrných snímcích křídel drozofily …více

Abstract

Tunneling nanotubes (TNTs) are thin, long structures that connect cells and allow them to exchange information and resources. They have been studied extensively in the last two decades, since they are thought to be involved in a number of physiological processes. This thesis presents a method for the detection and quantification of TNTs in multidimensional fluorescence microscopy images of Drosophila …více

Zadání práce
The primary objective of this thesis is to investigate the possibilities of machine-learning-free methods for segmenting curvilinear structures in volumetric bioimage data and to develop a reliable image analysis pipeline for segmenting and quantifying tunneling nanotubes in multidimensional fluorescence microscopy image data of Drosophila's wings. The textual part of the thesis must include a concise and comprehensive description of the developed pipeline and its quantitative evaluation focused on segmentation accuracy, execution time, and memory consumption. The implementation of the developed pipeline will be delivered in an easy-to-use form and complemented with a practical guide that documents the exemplary usage of the developed pipeline.
Práce zkontrolována:
24. 5. 2025 07:02, doc. RNDr. Martin Maška, Ph.D., učo 60734
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
26. 6. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Martin Maška, Ph.D., učo 60734
KVI FI MU

Oponent

doc. RNDr. Pavel Matula, Ph.D., učo 2927
KVI FI MU

Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Plán
Informatika
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.