Alternativa bakalářské práce: Tereza Horáková: Rostliny s nekanonickými telomerovými sekvencemi
Alternativa bakalářské práce
Rostliny s nekanonickými telomerovými sekvencemi
Plants with non-canonical telomeric sequences
Anotace
Telomerová DNA se u většiny suchozemských rostlin skládá z vysoce konzervovaných, tandemově uspořádaných sekvencí (TTTAGGG/CCCTAAA)n, které jsou syntetizovány specializovaným telomerázovým komplexem složeným z podjednotek telomerázové reverzní transkriptázy (TERT) a telomerázové RNA (TR). Nedávné genomické studie však odhalily nekanonické telomerové motivy u více rostlinných linií, což naznačuje, že …více
Abstract
Telomeric DNA in most land plants consists of the highly conserved (TTTAGGG/CCCTAAA)n tandemly arranged repeats, synthesised by the specialised telomerase complex comprising the telomerase reverse transcriptase (TERT) and telomerase RNA (TR) subunits. However, recent genomic studies have revealed the non canonical telomeric motifs in multiple plant lineages, suggesting that mutations and diversification …více
Zadání alternativy bakalářské práce
Sekvence TTTAGGG/CCCTAAA reprezentuje kanonickou telomerovou repetici rostlin a je považována za původní rostlinný telomerový motiv. I když míra evoluční konzervativnosti tohoto telomerového motivu je vysoká, byly identifikovány rostlinné druhy s telomerami tvořenými odlišnými sekvencemi; a takových rostlin stále přibývá. V evoluci rostlinných telomer hrála velmi pravděpodobně důležitou roli telomerová RNA (TR). Jde o nekódující RNA, která obsahuje templátové místo, podle kterého druhá esenciální podjednotka enzymového komplexu telomerázy, telomerázová reverzní transkriptáza (TERT), syntetizuje G-bohaté vlákno telomery. V bakalářské práci budou shrnuty současné poznatky o evoluci telomerové repetice rostlin a významu TR v tomto procesu.
V experimentální části budou metodou TRF (terminal restriction fragments) analyzovány telomery v rostlinách A. thaliana s nefunkčním genem kódujícím TR a v těchto mutantech transformovaných konstruktem nesoucím TR s templátovou sekvencí odpovídající telomerové repetici savců (TTAGGG/CCTAAA).
Tato bakalářská práce je součástí širší studie, jejímž cílem je pochopením mechanismů evoluční adaptace rostlin na změny sekvence telomerové repetice.
Cíle práce
Teoretická část:
- Telomery rostlin, mechanismy jejich udržování a sekvenční diverzita.
Praktická část:
- Pěstování rostlin A. thaliana s nefunkčním genem kódujícím TR a mutantů transformovaných konstruktem s lidskou teplátovou sekvencí
- Izolace DNA, analýza délek telomer metodou TRF; pro hybridizaci budou použity radioaktivně značené sondy reflektující rostlinný i savčí telomerový motiv.
19. 5. 2025 13:10, Mgr. Michal Závodník, Ph.D.
Upozornění:
Závěrečná práce byla v souladu s § 47b zákona o vysokých školách skryta z důvodu překážky pro její zveřejnění do 14. 5. 2035.
Odůvodnění: Zveřejnění Závěrečného projektu je odloženo do 14.5.2035.
Vedoucí
ÚBioch Chem PřF MU
Konzultant
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Charakterizace interakce mezi TERT a telomerásovou RNA u A.thaliana
Mgr. Daniela Segedyová -
Rekonstrukce telomerového fenotypu pomocí zpětného křížení s divokým typem a vzájemného křížení T-DNA mutantů Arabidopsis.
Mgr. Martin Sivčák -
Dynamika délek telomer v kalusech Arabidopsis thaliana
Bc. Jonáš Pospíchal -
Telomery jako ukazatel relativního stáří a stárnutí organismu u ptáků
Bc. Erika Janáčová -
Telomery v mutantních liniích Physcomitrium patens s aktivovaným mechanismem alternativního prodlužování telomer
Mgr. Anna Vávra -
Délka telomer a lidské zdraví
Bc. Filip Kulpa -
Vliv rodičovského stárnutí halančíka tyrkysového (Nothobranchius furzeri) na potomstvo z pohledu dynamiky délek telomer
Mgr. Anna Kromerová, učo 499115 -
Dynamika rDNA a telomerových repetic v průběhu reverze fas mutant Arabidopsis thaliana
Mgr. Michal Jež




