Alternativa bakalářské práce

Rostliny s nekanonickými telomerovými sekvencemi

Plants with non-canonical telomeric sequences

Tereza Horáková
Anotace

Telomerová DNA se u většiny suchozemských rostlin skládá z vysoce konzervovaných, tandemově uspořádaných sekvencí (TTTAGGG/CCCTAAA)n, které jsou syntetizovány specializovaným telomerázovým komplexem složeným z podjednotek telomerázové reverzní transkriptázy (TERT) a telomerázové RNA (TR). Nedávné genomické studie však odhalily nekanonické telomerové motivy u více rostlinných linií, což naznačuje, že …více

Abstract

Telomeric DNA in most land plants consists of the highly conserved (TTTAGGG/CCCTAAA)n tandemly arranged repeats, synthesised by the specialised telomerase complex comprising the telomerase reverse transcriptase (TERT) and telomerase RNA (TR) subunits. However, recent genomic studies have revealed the non canonical telomeric motifs in multiple plant lineages, suggesting that mutations and diversification …více

Zadání alternativy bakalářské práce

Sekvence TTTAGGG/CCCTAAA reprezentuje kanonickou telomerovou repetici rostlin a je považována za původní rostlinný telomerový motiv. I když míra evoluční konzervativnosti tohoto telomerového motivu je vysoká, byly identifikovány rostlinné druhy s telomerami tvořenými odlišnými sekvencemi; a takových rostlin stále přibývá. V evoluci rostlinných telomer hrála velmi pravděpodobně důležitou roli telomerová RNA (TR). Jde o nekódující RNA, která obsahuje templátové místo, podle kterého druhá esenciální podjednotka enzymového komplexu telomerázy, telomerázová reverzní transkriptáza (TERT), syntetizuje G-bohaté vlákno telomery. V bakalářské práci budou shrnuty současné poznatky o evoluci telomerové repetice rostlin a významu TR v tomto procesu.
V experimentální části budou metodou TRF (terminal restriction fragments) analyzovány telomery v rostlinách A. thaliana s nefunkčním genem kódujícím TR a v těchto mutantech transformovaných konstruktem nesoucím TR s templátovou sekvencí odpovídající telomerové repetici savců (TTAGGG/CCTAAA).

Tato bakalářská práce je součástí širší studie, jejímž cílem je pochopením mechanismů evoluční adaptace rostlin na změny sekvence telomerové repetice.

Cíle práce

Teoretická část:

  • Telomery rostlin, mechanismy jejich udržování a sekvenční diverzita.

Praktická část:

  • Pěstování rostlin A. thaliana s nefunkčním genem kódujícím TR a mutantů transformovaných konstruktem s lidskou teplátovou sekvencí
  • Izolace DNA, analýza délek telomer metodou TRF; pro hybridizaci budou použity radioaktivně značené sondy reflektující rostlinný i savčí telomerový motiv.
Práce zkontrolována:
19. 5. 2025 13:10, Mgr. Michal Závodník, Ph.D.

Upozornění:

Závěrečná práce byla v souladu s § 47b zákona o vysokých školách skryta z důvodu překážky pro její zveřejnění do 14. 5. 2035.

Odůvodnění: Zveřejnění Závěrečného projektu je odloženo do 14.5.2035.

Jazyk alternativy bakalářské práce
angličtina angličtina
Termín rozpravy
26. 6. 2025
Rozprava proběhla úspěšně

Vedoucí

Mgr. Michal Závodník, Ph.D.
ÚBioch Chem PřF MU

Zpravodaj

Mgr. Kateřina Dadáková, Ph.D., učo 147047
ÚBioch Chem PřF MU

Konzultant

doc. Mgr. Miloslava Fojtová, CSc., učo 54730
NCBR PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.