Diplomová práce se zaměřuje na návrh a implementaci sady rozšíření aplikace Mol*. Jedná se o webovou aplikaci pro vizualizaci molekulárních struktur, která je vyvíjena ve spolupráci s PDBe a RCSB PDB. Student bude navržená rozšíření úžce konzultovat s jedním z hlavních vývojářů aplikace, Dr. Alexanderem Rose (RCSB Protein Data Bank, San Diego). V rámci práce student aplikaci rozšíří o: - vhodnou implementaci techniky ambientní okluze, - vykreslení kontur zobrazované molekulární struktury, jejichž tloušťku bude moci uživatel ovlivnit buď zadáním absolutní hodnoty v pixelech nebo jako poměr k velikosti vykreslované struktury, - plnohodnotnou podporu pro vykreslování průhledných objektů (vycházejících z jednotlivých zobrazovacích strategií), - implementaci techniky adaptivního ořezávání objektů, aby měl uživatel intuitivní náhled na důležitá místa uvnitř struktur. Praktická část práce cílí na funkční implementaci navržených řešení do aplikace Mol*, v textové části pak student popíše princip fungování jednotlivých navržených řešení.