Diplomová práce bude zaměřena na řešení struktur biomolekul a studium interakcí proteinů s malými ligandy pomocí moderních strukturních metod. Student se ve své diplomové práci „Proteinová krystalografie a určování interakce protein-substrát za pomoci NMR technik“ bude zabývat širokým využitím krystalizačních podmínek k získání enzymu ornithinaminotransferasy v krystalické podobě a také možnému řešení struktury tohoto enzymu. Práce bude zahrnovat prohloubení znalostí v metodologii rentgeno-strukturní analýzy proteinů a to od procesu krystalizace až po řešení a upřesňování struktury. Student si také v průběhu diplomové práce bude osvojovat možnosti využití NMR technik na sledování interakcí protein-substrát. K tomuto účelu bude sloužit lektin RSL z organismu Ralstonia solanacerum. Student si zde osvojí techniky, které mu umožní sledovat drobné strukturní změny v proteinu v závislosti na chemii substrátu, čím by měl být schopen vyhodnotit tyto data na základe výpočetních metod v NMR a odvodit disociační konstanty jednotlivých interakcí proteinu s určenými substráty. Vzhledem k širokému záběru této práce bude student také muset prokázat schopnost práce s literaturou, krystalografickými databázemi a různými výpočetními metodami.