Symbiotické organismy, tj. mikrobiota, ovlivňují vývoj, fyziologii, chování, ekologii (interakce s vnějším prostředím) i evoluci (adaptace k environmentálním změnám) asociovaného hostitele. Mikrobiota hraje důležitou roli v udržování homeostázy a v ochraně hostitele před infekcí. Specifita mikrobiálních společenstev a potenciální interakce mezi mikrobiotou a parazitofaunou u rybích hostitelů představuje aktuální ekologické téma ve výzkumu hostitelsko-parazitických interakcí. Dosavadní studie naznačují, že mezidruhoví hybridi jsou vnímaví k infekci hostitelsko-specifickými parazity rodičovských druhů, avšak míra parazitární infekce se liší mezi hybridními generacemi v závislosti na míře genetické kompatibility mezi hostitelem a parazitem. Cílem diplomové práce je analýza kožní a žaberní mikrobioty a společenstev parazitů (s důrazem na hostitelsky-specifické parazity) a analýza potenciálních interakcí mikrobiota-paraziti u čistých rodičovských linií a vybraného spektra hybridních generací.