Závěrečná práce: Vojtěch Veselý: Design and Implementation of the AEON Tool Frontend
Bakalářská práce
Design and Implementation of the AEON Tool Frontend
Anotace
Nástroj BIODIVINE/AEON je jedním z mála softwarových frameworků navržených speciálně pro modelování a analýzu částečně specifikovaných booleovských sítí (PSBN). Na začátku této práce čelil AEON dvěma zásadním omezením: nově zavedená control funkcionalita byla neúplná a frontend se opíral o zastaralou a obtížně udržovatelnou architekturu. Řešení těchto problémů vyžadovalo jak dokončení klíčových control …více
Abstract
The BIODIVINE/AEON tool is one of the few software frameworks designed specifically for modeling and analyzing Partially Specified Boolean Networks (PSBNs). At the beginning of this thesis, AEON faced two major limitations: its newly introduced control functionality was incomplete, and its frontend relied on an outdated and difficult-to-maintain architecture. Addressing these challenges required both …více
Zadání práce
The goal of the thesis is the development of a novel web frontend for the tool Biodivine/AEON, serving for attractor analysis and control of asynchronous Boolean Networks. First, the student will become familiar with the web-based version of the tool and the prototype version that incorporates control features. The student will explore the requirements of target users as well as the performance issues related with the previous releases of the software (v0.1.0, v0.4.1) based purely in HTML/Javascript. The previous implementation’s reliance on plain web technologies made further development difficult. The lack of modularity resulted in tightly coupled components, complicating updates and maintenance.
The practical goal will be to design and implement a new version of the frontend that is easily maintainable and extensible, and provides better performance than the previous solution. The new frontend will be developed using React, TailwindCSS, and TypeScript. These technologies will provide a modular and maintainable architecture, improved performance, and a modern visual design.
The resulting implementation will be delivered in terms of a new release of the tool, including adequate documentation.
22. 12. 2025 22:35, doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D., učo 3159
Konzultant
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Online repository for exploring Boolean networks
Mgr. Matěj Zábojník, učo 493105 -
Influence maximization in partially specified Boolean networks
Mgr. Šimon Varga -
Web chovatelského spolku
Bc. Tomáš Rabel -
Používateľský portál platformy EnviLab
Ing. Marcel Krošlák -
New user interface for data collection in RES-Q
Ing. et Ing. Dominik Rumian -
Modernizing AEON web frontend
Bc. Josef Žižka -
Využitie LLM na extrakciu formálnych vlastností biologických modelov z literatúry
Ing. Richard Harman -
Návrh a implementácia webového rozhrania pre správu konfigurácie systému
Bc. Nina Medveďová




