Závěrečná práce: Mgr. Matej Troják, učo 410129: Formal Analysis of Rule-Based Models in Systems Biology
Rigorózní práce
Formal Analysis of Rule-Based Models in Systems Biology
Anotace
Matematické modelovanie v systémovej biológii s využitím bežných prístupov je obvykle obmedzené kombinatorickou explóziou na úrovni popisu modelu. Jedným z potenciálnych prístupov, ktorý rieši tento problém, je špecifikácia biochemických interakcií pomocou pravidiel, ktoré umožňujú prezentáciu v stručnej a zrozumiteľnej forme. Takýto model založený na pravidlách sa dá použiť na automatické vygenerovanie …více
Abstract
The conventional mathematical modelling in systems biology is usually limited by the combinatorial explosion on the level of model description. One of the potential approaches is the idea to specify the biochemical interactions as rules, which allow the presentation in a concise and understandable form. The rule-based model can be used to generate different mathematical models automatically. The main …více
26. 11. 2019 07:13, prof. RNDr. Luboš Brim, CSc.
Oponenti
Faculty of Computer Science, University of Namur
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Syntéza parametrů pro sigmoidální kinetické modely
Mgr. Aleš Pejznoch, učo 324751 -
Zrychlení syntézy parametrů pro stochastické modely
Mgr. Petr Pilař, učo 374381 -
Parameter Synthesis of Dynamical Systems via Model Checking
RNDr. Martin Demko, Ph.D., učo 325073 -
Rule-based Modelling of Biochemical Processes: Specification and Analysis
RNDr. Matej Troják, Ph.D., učo 410129 -
Parallel Parameter Synthesis for Hybrid Systems
RNDr. Eva Šmijáková, učo 433478 -
Syntéza parametrů pro sigmoidální kinetické modely
Mgr. Aleš Pejznoch, učo 324751 -
Formal Methods for Model Selection in Systems Biology
RNDr. Matej Hajnal, učo 374185 -
Paralelní syntéza parametrů z formulí hybridní logiky HUCTL
RNDr. Samuel Pastva, Ph.D., učo 410286




