Závěrečná práce: Bc. Petr Pilař, učo 374381: Zrychlení syntézy parametrů pro stochastické modely
Diplomová práce
Zrychlení syntézy parametrů pro stochastické modely
Accelerating parameter synthesis for stochastic models
Anotace
Výsledkem práce je efektivní implementace existujících technik syntézy parametrů pro stochastické systémy a o konkrétně pro continuous-time Markov Chains (CTMCs). Tyto techniky iterativně rozkládají parametrický prostor na jeho podprostory a aproximují funkci, která pro libovolné hodnoty parametrů z parametrického prostoru vrací pravděpodobnost, že je daná formule splněna v CTMC daným těmito hodnotami …více
Abstract
We provide an efficient implementation of existing parameter synthesis techniques for stochastic systems modelled as continuous-time Markov chains (CTMCs). These techniques iteratively decompose the parameter space into its subspaces and approximate the satisfaction function that for any parameter values from the parameter space returns the probability of the formula being satisfied in the CTMC given …více
Zadání práce
Parameter synthesis techniques for continuous-time Markov chains have been described in [1,2] and implemented on top of the tool PRISM [3].
The goal of this thesis is to accelerate the current implementation [4] in order to make the parameter synthesis feasible for larger models. The student will first optimise the implementation using effective representation of the model based on sparse data structures. The main objective of the thesis is to design and implement a GPU acceleration of the parameter synthesis. The student is also required to provide a detailed experimental evaluation of the GPU implementation and compare it with the optimised sequential implementation on relevant models including biochemical models as well as models of computer and engineering systems.
26. 5. 2015 11:36, doc. RNDr. Milan Češka, Ph.D.
- Zadáno/změněno 22. 6. 2015 15:48, Alena Dvořáková
- Záznam založen 8. 4. 2015 15:33, RNDr. Ing. Lucie Pekárková, učo 60555
- Zveřejnit od 25. 5. 2015 10:32, Alena Dvořáková
- Práce převzata 25. 5. 2015 10:32, Alena Dvořáková
Přílohy
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Syntéza parametrů pro sigmoidální kinetické modely
Mgr. Aleš Pejznoch, učo 324751 -
Parameter Synthesis of Dynamical Systems via Model Checking
RNDr. Martin Demko, Ph.D., učo 325073 -
Formal Analysis of Rule-Based Models in Systems Biology
RNDr. Matej Troják, Ph.D., učo 410129 -
Parallel Parameter Synthesis for Hybrid Systems
RNDr. Eva Šmijáková, učo 433478 -
Syntéza parametrů pro sigmoidální kinetické modely
Mgr. Aleš Pejznoch, učo 324751 -
Formal Methods for Model Selection in Systems Biology
RNDr. Matej Hajnal, učo 374185 -
Paralelní syntéza parametrů z formulí hybridní logiky HUCTL
RNDr. Samuel Pastva, Ph.D., učo 410286 -
Model Checking Based Parameter Synthesis of Dynamical Systems in Biology
RNDr. Martin Demko, Ph.D., učo 325073




