Diplomová práce

Genomová sekvence T. pallidum DAL-1 a cesta k definici jeho transkriptomu

Genome sequence T. pallidum DAL-1 and prediction of its transcriptome

Bc. Pavol Mikolka, učo 184403
Anotace

Treponema pallidum je pôvodca ochorenia - syfilis. Je to veľmi zvláštna baktéria s mnohými rozdielmi od iných mikroorganizmov. Aj napriek veľkému záujmu vedcov, mechanizmy potogenézy a zodpovedajúce faktory virulencie tejto baktérie nie sú známe. T. pallidum nie je schopná prežiť mimo hosťujúci organizmus kvôli obmedzenej metabolickej kapacite a drasticky zníženej genómovej informácii. Porovnanie kompletných …více

Abstract

Treponema pallidum is the causative agent of syphilis. It is a very special bacterium with many differences from the other microorganisms. Despite the great interest of scientists, the pathogenic mechanisms and the corresponding virulence factors of these bacteria are not known. T. pallidum does not survive outside the mammalian host because of its limited metabolic capacity and a drastically reduced …více

Klíčová slova
Treponema pallidum syfilis kmeň DAL-1 celogenómová sekvencia analýza transkriptomu syphilis strain DAL-1 genome sequence transcriptome
Zadání práce
Rod Treponema zahrnuje několik druhů a poddruhů patogenních spirochet. Infekce způsobované patogenními treponematy představují skupinu onemocnění s podobnými symptomy a epidemiologií, ve které invazivita klesá od venerické syfilis k pintě. Vzhledem ke známé genomové sekvenci těchto bakterií je třeba analyzovat transkriptom těchto bakterií jako možnou příčinu jejich odlišné patogenity. Cílem této diplomové práce je studium genové exprese u několika zástupců patogenních spirochet rodu Treponema s použitím metod funkční genomiky. Tyto metody zahrnují techniku expresního profilování pomocí sekvenace cDNA, techniku DNA-microarray a expresní analýzu vybraných genů metodou real-time PCR. Nalezené rozdíly v trankripčních profilech budou porovnány s odlišných patogenním potenciálem vyšetřených treponem.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
24. 5. 2010 09:58, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116
Plný text práce
3,8 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
10. 6. 2010
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116
VSDS BiolÚ Teorie LF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.