Diplomová práce

Sběr dat z enzymového biosensoru pomocí systému Raspberry Pi

Data recording from enzyme biosensor using the Raspberry Pi system

Bc. Matej Forgáč
Anotace

V dnešní době probíhá spousta biochemických experimentů. Biochemické experimenty musí být měřeny a analyzovány, aby se zjistilo, co se stalo. Jedním ze způsobů je měření experimentu pomocí biosenzoru. Biosenzor je zařízení určené k měření konkrétní biochemické látky nebo reakce. Měření lze provést chronoamperometrií. Data z měření je nutné vizualizovat a uložit. V této diplomové práci byly enzymy imobilizovány …více

Abstract

There are a lot of biochemical experiments going on nowadays. The biochemical experiments must be measured and analyzed to see what happened. One of the ways is to measure the experiment with a biosensor. The biosensor is a device designated to measure a particular biochemical substance or reaction. The measurement can be done by chronoamperometry. The data from the measurement must be visualized and …více

Zadání práce
Jednodeskový linuxový mikropočítač Rasperry Pi (Zero W varianta) je výkonným systémem pro snímání signálu z elektrochemického enzymového biosensoru, grafickou prezentaci dat na standardní obrazovce a nebo na malém displeji, vzhledem k bezdrátové WiFi komunikaci se nabízí i alternativní přístup přes webové rozhraní.
Cílem práce bude v programovacím jazyce Python (ver. 3) navrhnout ovládací program zajišťující následující funkce:
- přenos signálu z dvoukanálového biosensoru (glukosa/laktát) pomocí A/D převodníku (MCP 3424 nebo ADS 1115, I2C komunikace) - řízení detektoru a záznamu dat přes dotykový display (textový režim, sériová komunikace - pySerial) v plně přenosném použití - bezdrátové řízení po WiFi, webové ovládací rozhraní (např. Flask) - GUI pro standardní monitor/myš/klávesnici - pokud budou připojeny (např. TKinter, PyGame, ...), graf průběhu dat v reálném čase (matplotlib, Plotly, pygal) - uložení dat na SD kartu, stažení přes webové rozhraní
Práce zahrne také experimentální konstrukci amperometrického biosensoru s měřícími elektrodami s glukosa oxidasou a s laktátoxidasou.

Zdroje informací

docs.python.org, wiki.python.org, www.raspberrypi.org, learn.adafruit.com/adafruit-io/python
Diplomové práce - MU: Václav Churý, Martin Pihar
Práce zkontrolována:
20. 5. 2022 11:20, prof. RNDr. Petr Skládal, CSc., učo 2202
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
16. 6. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Petr Skládal, CSc., učo 2202
ÚBioch Chem PřF MU

Oponent

doc. Mgr. Zdeněk Farka, Ph.D., učo 357740
ÚBioch Chem PřF MU

Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Bioinformatika
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.