Doctoral thesis

Rule-based Modelling of Biochemical Processes: Specification and Analysis

RNDr. Matej Troják, UČO 410129
Abstract

Modelovanie v systémovej biológii je kľúčovým nástrojom pri skúmaní študovaných systémov. Existuje mnoho prístupov k modelovaniu, medzi ktorými prepisovanie poskytuje vhodný mechanistický prístup na popisovanie systémov. Medzi prepisovacie formalizmy vhodné a osvedčené pre modelovanie v biológii patrí aj tzv. modelovanie založené na pravidlách. Tento prístup využíva abstraktný popis, ktorý umožňuje …more

Abstract

In systems biology, models play a crucial role in understanding the studied systems. There are many modelling approaches, among which rewriting systems provide a framework for describing systems on a mechanistic level. Besides other formalisms based on rewriting, the rule-based approach is one of the most suitable and well-established for modelling in biology. The approach employs abstraction that …more

Keywords
systems biology rule-based modelling formal analysis regulated rewriting
Administrative information
The thesis has been checked:
31/1/2023 08:01, prof. RNDr. Luboš Brim, CSc.
Full text of thesis
3,7 MB / file PDF
Attachments (2)
Language used
English English
Defence date
13/6/2023
The thesis was defended successfully

Supervisor

prof. RNDr. Luboš Brim, CSc.
KTP FI MU

Readers

prof. Jean-Marie Jacquet
University of Namur
prof. Andrew Millar
University of Edinburgh

Consultants

Ing. Jan Červený, Ph.D., UČO 118661
ÚBioch Chem PřF MU
doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D., UČO 3159
KSUZD FI MU
Cite this text
Masaryk University Faculty of Informatics
Programme
Plan
Fundamentals of Computer Science

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.

Similar documents

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.