Diplomová práce

Stanovení vnitřní dynamiky proteinu MAP2c pomocí kros-korelované NMR relaxace.

Determination of internal dynamics of protein MAP2c using cross-correlated NMR relaxation

Bc. Erik Nomilner
Anotace

Mezi všemi proteiny, které jsou nezbytné pro správné fungování buňky, existuje velká část těch, které nemají definovanou 3D strukturu. Jedním z těchto tzv. přirozeně neuspořádaných proteinů je Microtubule Associated Protein 2c který se podílí na regulaci stability a dynamiky mikrotubulů nervových buněk. Funkce přirozeně neuspořádaných proteinů souvisí s přechody …více

Abstract

Among all the proteins that are essential for the right cellular functionality, there is large portion of those, which lack of defined 3D structure. One of these so-called Intrinsically disordered proteins is Microtubule Associated Protein 2c, which is involved in the regulation of the stability and dynamics of microtubules of neural cells. The function of Intrinsically Disordered Proteins arises from …více

Klíčová slova
NMR přirozeně neuspořádané proteiny relaxace dynamika MAP2c Intrinsically disordered proteins relaxation dynamics
Zadání práce
Protein MAP2c (Microtubule associated protein 2c) je exprimován v dendritech neuronů během embryonálního vývoje mozku a podílí se na regulaci tvorby mikrotubulů. Jeho C-terminální část vykazuje vysokou sekvenční podobnost s proteinem Tau, který tvoří agregáty v mozku pacientů trpících Alzheimerovou chorobou. Lokalizace MAP2c a předpokládané fyziologické role Tau a MAP2c se ale liší. Nedávné výsledky naší laboratoře odhalily výrazné rozdíly ve fosforylaci MAP2c a Tau. MAP2c i Tau jsou přirozeně neuspořádané proteiny, které netvoří stabilní trojrozměrné struktury. Pro takového proteiny je dynamika vnitřních pohybů důležitým parametrem. V přídadě Tau byla dynamika molekuly sledována pomocí NMR relaxací. Pro MAP2c byly již naměřeny auto-korelované relaxační rychlosti. Jejich hodnoty jsou ale ovlivněny přítomností isotopu 13C. Cílem práce je využít pro studium dynamiky kros-korelované relaxační rychlosti, jejichž určení je sice obtížnější, ale které poskytují výsledky, které nejsou výrazně zkresleny přítomností 13C. Úkolem studenta bude naměřit spektra pro určení kros-korelovaných relaxačních rychlostí jednotlivých aminokyselin proteinu MAP2c s vysokým rozlišením a analýzou výsledků tyto rychlosti stanovit a využít k popisu vnitřní dynamiky proteinu.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
16. 5. 2019 07:08, prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990
Plný text práce
3,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
10. 6. 2019
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990
NCBR PřF MU

Oponent

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc., učo 564

Konzultant

Mgr. Kateřina Bendová, Ph.D., učo 258872
BNMRS CSB CEITEC MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.