Bakalářská práce

Zkoumání mechanizmu zádrže nukleobází a deoxynukleotidů jako elementů oligonukleotidů v chromatografickém systému HILIC/ERLIC

Investigating retention mechanism of nucleobases and deoxynucleotides as elements of oligonucleotides in the HILIC/ERLIC chromatographic system

Petra Tomiczková
Anotace

Bakalářská práce se zabývá studiem vlivu proměnných parametrů mobilní fáze na separaci a retenční charakteristiky nukleových bází a nukleotidmonofosfátů metodou kapalinové chromatografie v systému HILIC/ERLIC. Cílem práce je najít takové parametry separace zmíněných analytů, které by bylo možno dále použít při modelování retenčních charakteristik oligonukleotidů. První část práce se zabývá teoretickými …více

Abstract

This bachelor thesis is focused on the study of influence of variable parameters of mobile phase on separation and retention characteristics of nucleobases and nucleotide monophosphates using liquid chromatography method in the HILIC/ERLIC system. The aim of this work is to find optimal conditions of separation of named analytes, that would be usable in retention characteristics modelling of oligonucleotides …více

Klíčová slova
Vysokoúčinná kapalinová chromatografie HILIC ERLIC nukleobáze nukleotidmonofosfáty
Zadání práce
Pro konstrukci funkčního modelu sekvenčně závislé separace ultrakrátkých oligonukleotidů v systému HILIC/ERLIC je potřeba zjistit lineární příspěvky jednotlivých struktur k celkové retenci. Oligonukleotid má tři výrazné strukturní motivy: nukleobázi, sacharid a fosfátovou skupinu. Při retenci uvažujeme, že strukturně-retenční význam budou mít především nukleobáze a fosfát cukr-fosfátové páteře. Fyzikálně, chemicky i svou polohou v řetězci se od sebe výrazně liší a je potřeba zjistit, jaký elementární vliv jednotlivé části mají. Cílem práce je získat a analyzovat retenční data nukleobází (A, C, G, T, U) a deoxynukleotidů (dAMP, dCMP, dGMP, dTMP, dUMP) v systémech HILIC/ERLIC s mobilními fázemi obsahujícími 80% organické složky (ACN a MeOH), variabilním obsahem iontových složek (TEA) a pH. Naměřená retenční data budou sloužit pro korelaci a modelování v rámci QSRR (kvantitativní vztahy mezi strukturou a retencí) systému ultrakrátkých oligonukleotidů (trinukleotidů).
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
31. 5. 2019 14:50, Mgr. Miroslava Bittová, Ph.D., učo 14556
Plný text práce
1,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
19. 6. 2019
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Miroslava Bittová, Ph.D., učo 14556
ÚChem Chem PřF MU

Oponent

Ing. Martina Nechvátalová, Ph.D., učo 478963
ÚChem Chem PřF MU

Konzultant

doc. Mgr. Jan Havliš, Dr., učo 743
NCBR PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Chemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.