Diplomová práce

Isocitrát dehydrogenáza u difúzních gliomů: mutační analýza genů IDH1/2 pomocí sekvenování nové generace (NGS)

Isocitrate dehydrogenase in diffuse gliomas: mutational analysis of IDH1/2 genes by Next-Generation Sequencing (NGS)

Bc. Kateřina Zettlová
Anotace

Isocitrát dehydrogenáza (IDH) je enzym, který hraje klíčovou roli v řadě biologických procesů, včetně Krebsova cyklu, metabolismu či buněčné homeostázy. Missense mutace v kodonu 132 genu IDH1 a 172 genu IDH2 (genů kódujících cytoplazmatické a mitochondriální formy enzymů – IDH1 a IDH2) jsou spojovány s procesem gliomageneze. Gliomy jsou nejčastějšími primárními nádory centrálního nervového systému …více

Abstract

Isocitrate dehydrogenase (IDH) is an essential enzyme that participates in several major biological processes, including the Krebs cycle, metabolism, and cellular redox homeostasis. Missense mutations in codon 132 of the IDH1 gene and 172 of the IDH2 gene (genes encoding cytoplasmic and mitochondrial forms of enzymes – IDH1 and IDH2) are associated with the process of gliomagenesis. Gliomas are the …více

Zadání práce
Isocitrát dehydrogenáza (IDH) je enzym katalyzující oxidativní dekarboxylaci isocitrátu na alfa-ketoglutarát za produkce NADPH, a hraje tak významnou roli v Krebsově cyklu, metabolismu látek či buněčné homeostáze. Mutace v genech kódujících cytoplazmatické a mitochondriální formy enzymu (IDH1/2) jsou spojovány s procesem onkogeneze. Od svého objevení (Parsons a kol., 2008) jsou primárně spojovány s difúzními gliomy, nejčastějšími primárními nádory CNS v dospělé populaci. V roce 2016 klasifikace CNS nádorů dle WHO prošla přelomovou změnou – standartní histopatologická klasifikace byla rozšířena o molekulární diagnostiku a mutační stav IDH1/2 se stal ústředním diagnostickým markerem difúzních gliomů. Gliomy představují heterogenní skupinu nádorů vykazující kromě různých morfologických a genetických znaků také velmi variabilní odpověď na terapii, přesná diagnostika a klasifikace nádoru je tedy pro volbu vhodné terapie klíčová. Zlatý standard diagnostiky, imunohistochemické stanovení (IHC), je schopen detekovat většinu mutací IDH (IDH1 R132H), nekanonické mutace (non-IDH1 R132H) však ne. Světová zdravotnická organizace proto v rámci integrované diagnostiky z roku 2021 doporučuje provést u všech IHC negativních gliomů (pacientů do 55 let) sekvenční analýzu. Tato práce bude zaměřena na stanovení mutačního stavu IDH1/2 pomocí sekvenování nové generace (NGS) u pacientů Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně (FNUSA) s cílem poskytnout klinickým lékařům zásadní informace pro stanovení správné diagnózy (dle WHO CNS5 klasifikace) a volbu vhodné terapie. Část práce se bude také věnovat verifikaci výsledků IHC s Real-Time PCR u vzorků, u kterých se verifikace molekulárně-genetickou metodou standartně neprovádí (tj. IHC pozitivních, IHC negativních u pacientů nad 55 let). Praktická část diplomové práce bude provedena v Laboratoři molekulární a genetické diagnostiky Mikrobiologického ústavu FNUSA ve spolupráci s I. Ústavem patologie FNUSA Brno.
Práce zkontrolována:
20. 5. 2024 07:18, Mgr. Milada Dvořáčková, Ph.D., MBA, učo 19683
Plný text práce
2,8 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
18. 6. 2024
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Milada Dvořáčková, Ph.D., MBA, učo 19683
MiÚ FN USA LF MU

Oponent

Mgr. Zbyněk Čech
CMBG - molekulární genetika

Konzultant

Mgr. Jan Vrbský, Ph.D., učo 10907
I.ORTK FN USA LF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.