Celogenomové de novo sekvenování rostlinných druhů je významné z hlediska studia jejich evolučních, genetických a molekulárních vztahů. U kulturních druhů se v současné době stává i významným nástrojem ve šlechtění při sekvenování např. planých genotypů zajímavých vlastností jako jsou různé typy odolností k patogenům, suchu nebo chladu. Tady je další strategie postupu zaměřena na asociační celogenomové mapování a identifikaci kandidátních genů těchto znaků. Aplikace těchto postupů ve šlechtění rostlin může vhodně doplnit klasické metody a významně je zefektivnit. Hovoříme o tzv. molekulárním šlechtění. Studium současného stavu této problematiky a perspektiva využití bude obsahem bakalářské práce. Zaměří se na rod Trifolium, který je významným rodem čeledě Fabaceae a zástupci druhů významnými pícninami.