Nádorové buňky uvolňují extracelulární váčky, zejména exosomy, které hrají významnou roli v mezibuněčné komunikaci v nádorovém mikroprostředí. Exosomy přenášejí biologicky aktivní molekuly, včetně proteinů, a jejich složení může odrážet fenotyp buněk, z nichž pocházejí. Změny v obsahu exosomů tak mohou ovlivňovat nádorovou progresi, invazivitu i odpověď na léčbu.
Caveolin–1 (CAV1) je membránový protein zapojený do organizace buněčných membrán, signalizace a transportních procesů. Alterace exprese CAV1 byly opakovaně spojovány se změnami chování nádorových buněk. Předpokládá se, že ztráta CAV1 může ovlivnit nejen buněčný proteom, ale i proteinové složení exosomů.
Tato diplomová práce se zaměřuje na porovnání proteomu exosomů produkovaných prostatickou karcinomovou buněčnou linií PC–3 typu wild type a PC–3 buněk s knockoutem proteinu CAV1, s cílem objasnit vliv CAV1 na exosomální profil nádorových buněk.

Cíle práce:
Vypracovat literární rešerši na dané téma.
Naučit se hodnocení dat v prostředí programovacího jazyka R
Provést proteomickou analýzu buněk a exosomů a stanovit změny v jejich obsahu.
Identifikovat a interpretovat proteiny a signální dráhy ovlivněné ztrátou CAV1 v exosomech nádorových buněk.

Seznam odborné literatury:
LLARENTE, Alicia a SANDVIG, Kirsten. Proteomic analysis of microvesicles released by the human prostate cancer cell line PC–3. Molecular and Cellular Proteomics. 2012, DOI: 10.1074/mcp.M111.012914.

NAVRÁTIL, Jiří, RAUDENSKÁ, Martina, KRATOCHVÍLOVÁ, Monika, BALVAN, Jan, SHAUL, Yoav David a MASAŘÍK, Michal. Orchestrating movement: the role of Caveolin–1 in migration and metastasis. Molecular Cancer. 2025, DOI: 10.1186/s12943–025–02469–6.

NI, Kareemah, WANG, Chenghao, CARNINO, Jonathan M. a JIN, Yang. The evolving role of caveolin–1: a critical regulator of extracellular vesicles. Medical Sciences (Basel). 2020, DOI: 10.3390/medsci8040046.