Diplomová práce

Fylogeneze a geometrická morfometrie lebek vybraných druhů rodu Apodemus (Rodentia: Murinae)

Phylogeny and cranial geometric morphometry of selected Apodemus species (Rodentia: Murinae)

Bc. Karolína Dúhová
Anotace

Myšice rodu Apodemus jsou běžné hlodavce obývající Palearktický region. Problémy mezidruhové variability a vztahů v rámci rodu nejsou navzdory významu zástupců (běžné hlodavce škodlivé v zemědělství a nesoucí zoonózy) dostatečně vyřešeny. Cílem této práce bylo prozkoumat fylogenezi a lebeční morfologii vybraných druhů rodu Apodemus. Výsledky práce přispívají k pochopení fylogenetické nebo morfologické …více

Abstract

Apodemus is common genus inhabiting the Palearctic region. Problem of interspecific variability of the genus is not sufficiently solved despite the importance of species (common pests carrying zoonoses). The aim of this work was to investigate phylogeny and cranial morphology of selected Apodemus species.The results of this work contribute to the understanding of phylogenetic or morphological interspecific …více

Zadání práce
Myšice rodu Apodemus jsou běžní hlodavci obývající téměř celý palearktický region. Evoluční historie, diverzita, inter- a intraspecifická variabilita zástupců tohoto rodu jsou však navzdory jejich běžnému výskytu a hospodářskému i medicínskému významu nejasné. První částí diplomové práce bude tedy vypracování fylogeneze rodu Apodemus na základě mitochondriálních a jaderných molekulárních dat všech dostupných druhů. Druhou částí diplomové práce bude morfometrická analýza stavějící na výsledcích zjištěné fylogeneze. Jejím cílem bude prozkoumat evoluci velikosti a tvaru lebky u vybraných šesti druhů rodu Apodemus, které se liší v preferovaných habitatech. Geometrická morfometrie je metodikou zvlášť dobře vybavenou pro studium těchto problémů, neboť umožňuje algebraicky oddělit velikost a tvar objektu a uchovává vazbu mezi fyzickou podobou objektů a jejich matematickou reprezentací v průběhu statistických analýz. Konkrétním cílem diplomové práce bude zaprvé zrekonstruovat fylogenezi rodu Apodemus za použití tří jaderných (RAG, IRBP a vWF) a jednoho mitochondriálního lokusu (cytochrom b) a zadruhé vyhodnotit velikostní a tvarové rozdíly lebek šesti vybraných druhů. Na základě výsledků geometrické morfometrie bude možné odpovědět na tyto otázky: Zda a v jakých tvarových a velikostních rysech se liší lebky těchto druhů; zda jsou tyto rozdíly závislé na fylogenetickém či environmentálním signálu (konkrétně obývaném habitatu); zda je intraspecifická variabilita srovnatelná mezi druhy; a jaký je vztah velikostní a tvarové rozdílnosti. V tomto kontextu můžeme předpokládat, že míra velikostní rozdílnosti bude fylogeneticky méně konzistentní, naopak míra tvarové rozdílnosti se bude s fylogenetickou vzdáleností zvětšovat až na případy vysvětlitelné evoluční konvergencí (např. obdobným typem habitatu). Literatura: Darvish et al. 2015. Journal of Mammalian Evolution, 22: 583-595. Filippucci et al., 2002. Biological Journal of the Linnean Society, 75: 395-419. Ge et al., 2019. Zoological Journal of the Linnean Society, 187: 518-534. Jojić et al. 2012. Zoologischer Anzeiger, 251: 26-37. Michaux et al., 2002. Molecular Phylogenetics and Evolution, 23: 123-136. Suzuki et al., 2008. Biochemical Genetics, 46: 329-346. Sakka et al., 2010. Biological Journal of the Linnean Society, 100: 797-821.
Práce zkontrolována:
9. 1. 2020 09:06, Mgr. Adam Konečný, Ph.D., učo 52434
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
4. 2. 2020
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Adam Konečný, Ph.D., učo 52434
ÚBZ Biol PřF MU

Oponent

prof. RNDr. Miloš Macholán, CSc., učo 31702
VyzObr ÚBZ Biol PřF MU

Konzultant

Mgr. Ondřej Mikula, Ph.D.
abs PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.