Disertační práce
Získaná ocenění: Ocenění děkana FI za vynikající disertační práci

Acceleration of image processing algorithms for single particle analysis by electron microscopy

RNDr. David Střelák
Anotace

Kryogenní elektronová mikroskopie (Cryo-EM) je v současné strukturní biologii důležitým oborem. Jedním z významných omezení Cryo-EM je však výpočetní náročnost, proto mnoho stávajících softwarových řešení využívá techniky High-Performance Computing (HPC), aby tyto výpočty přivedlo do oblasti praktické použitelnosti. Obvyklé přístupy k urychlení spočívají v paralelizaci zpracování, ale v praxi se setkáváme …více

Abstract

Cryogenic Electron Microscopy (Cryo-EM) is a vital field in current structural biology. However, one of the significant limitations of Cryo-EM is the computational complexity, hence many existing software solutions use high-Performance Computing (HPC) techniques to bring these computations to the realm of practical usability. The common approach to acceleration is parallelization of the processing …více

Klíčová slova
Cryo-EM SPA HPC Autotuning GPU Optimization Performance Optimalizace výkonu
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
1. 6. 2022 10:37, prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., učo 1904
Plný text práce
55,7 MB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
24. 10. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., učo 1904
KPSK FI MU
Carlos Oscar Soranzo Sánchez, PhD
Universidad Autónoma de Madrid

Oponenti

Prof. Carmen San Martín
CNB-CSIC Madrid
Prof. Anne C. Elster
Norwegian University of Science and Technology

Konzultant

doc. RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D., učo 72898
KPSK FI MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Plán
Technologie a metodologie počítačových systémů

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.