Disertační práce

Functional and structural study of RNA-binding proteins involved in RNA metabolism

Mgr. Veronika Bačíková
Anotace

RNA-vázající proteiny se aktivně účastní transcripce a maturace RNA a jsou tak nedílnou součástí živé buňky. Tato práce se zabývá proteiny rozpoznávající RNA a snaží se je představit jako velmi rozmanitou skupinu. Domény rozpoznávající RNA jsou sice relativně malé a jejich typů není mnoho, přesto si osvojily schopnost vázat různé sekvence a struktury RNA molekul. Pomocí přídavných strukturovaných elementů …více

Abstract

RNA-binding proteins (RBPs) are an irreplaceable component of living cell, as they actively participate during RNA transcription and maturation. This work introduces RBPs as a versatile group which adopted several strategies how to recognize many RNA sequential and shape motifs despite limited amount of RNA-binding domain (RBD) types. Structurally, small RBDs can extend RNA-binding surface with additional …více

Klíčová slova
RNA vázající protein RNA metabolismus Nrd1 protein RNA-rozpoznávající motif ukončení transkripce nekódující RNA RNA-binding protein RNA metabolism RNA-recognition motif transcription termination non-coding RNA
Zadání práce
RNA vázající proteiny hrají důležitou roli při biogenezi RNA. Tyto proteiny rozpoznávají specifické sekvence RNA, rekrutují různé enzymy na specifická místa, řídí sbalování RNA do správných 3D konformací, nebo se například nespecificky nabalují na RNA a tím ji chrání před degradací. Cílem studia bude zjistit, jak některé RNA vázající proteiny, které jsou spojovány s metabolismem RNA (jako například MPP6), interagují s RNA. Ke studiu budou použity techniky molekulární biologie a biofyzikální metody. Nukleární magnetická rezonance bude použita jako hlavní metoda k získání tří dimenzionálních strukturních informací o studovaných systémech. Tento projekt objasní podstatu některých signálních mechanismů, které řídí metabolismus RNA.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
4. 5. 2013 15:54, prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D., učo 19362
Plný text práce
11,9 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
27. 5. 2013
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D., učo 19362
NCBR PřF MU

Oponenti

doc. Mgr. Lukáš Trantírek, Ph.D., učo 8725
BNMRS CSB CEITEC MU
Mgr. Libor Krásný, PhD.
Mikrobiologický ústav AV ČR
Autor posudku dosud neidentifikován.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie (čtyřleté)
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.