Diplomová práce

Vztah struktury a funkce telomerových proteinů

Structure-function relationship of telomeric proteins

Bc. Pavel Veverka, učo 379485
Anotace

Tato diplomová práce se věnuje studiu interakcí vybraných proteinů shelterinového komplexu pomocí NMR spektroskopie, fluorescenční anizotropie a gelové retardační analýzy. Telomery jsou nukleoproteinové struktury vyskytující se na koncích chromozomů eukaryotických buněk. Telomerová DNA je tvořena z mnoha repetic konzervované sekvence – u člověka 5‘ TTAGGG-3’. Délka repetic se při každém dělení zkracuje …více

Abstract

This diploma thesis focuses on studying interactions of shelterin proteins using NMR spectroscopy, fluorescence anisotropy and gel retardation analysis. Telomeres are nucleoprotein structures located at the end of chromosomes of eukaryotic cells. Telomeric DNA consists of repetitive sequence – for example 5'-TTAGGG-3' in humans. The length of telomeres is shortened at each cell division. Telomeric …více

Klíčová slova
DNA telomery shelterin protein interakce TRF2 POT1 TPP1 NMR fluorescenční telomeres interaction fluorescence
Zadání práce

Telomery jsou nukleoproteionové komplexy zajištující ochranu terminálních úseků DNA chromozomů před nechtěnými opravami reparačními mechanismy. Telomery zabraňují ztrátě genetické informace při nedokonalé replikaci a zajišťují tak stabilitu celého genomu. Prodlužování délky telomer je úzce spjato s karcinogenní transformací buněk. Telomerové proteiny se sdružují do komplexu nazvaného shelterin (ochránce).

Ke studiu mechanismu vazby, formování a ochrany DNA proteiny shelterinu bude využito kombinace kvantitativních biofyzikálních technik a podrobné strukturní analýzy.

Hlavním úkolem práce je zjištění nových vztahů mezi funkcí a vzájemnou afinitou telomerových proteinů a DNA. Tyto znalosti mohou být využity k navrhování nových léčiv založených na oslabení vzájemných interakcí těchto pro buňku životně důležitých proteinů. Získané znalosti tak mohou posloužit k cílenému navrhování inhibitorů nejdůležitějších interakcí, které povedou k řízené destabilizaci genomu nádorových buněk.


Literatura:
  • Chen, Y., et al., A shared docking motif in TRF1 and TRF2 used for differential recruitment of telomeric proteins. Science, 2008. 319(5866): p. 1092-1096.
  • de Lange, T., Shelterin: The protein complex that shapes and safeguards human telomeres. Genes Dev, 2005. 19(18): p. 2100-10
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
25. 5. 2015 16:47, doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D., učo 7807
Plný text práce
2,7 MB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
17. 6. 2015
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D., učo 7807
NCBR PřF MU

Oponenti

prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D., učo 19362
Autor posudku dosud neidentifikován.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Fyzika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.