ZADÁNÍ BAKALÁŘSKÉ PRÁCE Postup a zásady pro vypracování: Cílem bakalářské práce je rešerše literatury zaměřená na působení kyseliny retinové na buněčné kultury, zejména lidské buňky MCF-7, a modelový organismus Danio rerio. V návaznosti na kyselinu retinovou se práce zaměří na Wnt/beta cateninovou dráhu s důrazem na změny genové exprese. 1) Práce s vědeckou literaturou, její vyhledávání a zpracování Student se naučí pracovat s vědeckou literaturou, vyhledávat publikace v internetových databázích. Literatura předaná vedoucím slouží pouze jako východisko a úvod do řešené problematiky - student musí rozšířit tento základ o nové vědecké poznatky. Získanou literaturu prostuduje a získané informace si smysluplně roztřídí. Termín: konec roku 2013, poté průběžně 2) Teoretická část bakalářské práce – literární rešerše Student zpracuje poznatky z literatury do přehledné, srozumitelné, ale zároveň přesné literární rešerše obsahující zejména následující body: - Stručný úvod do problematiky kyseliny retinové, syntetické dráhy v MCF-7 buňkách a D. rerio, s důrazem na Wnt/beta kateninovou dráhu, ovlivnění genové exprese, návaznost na problematiku sinic. - Molekulárně biologické techniky, možnosti využití metody kvantitativní real-time PCR. Termíny: návrh obsahu – 15.12.2013, hrubá verze I – 30.1.2014, hrubá verze II – 28.2.2014, finální verze I – 30.3.2014, poslední kontrola před odevzdáním – 20.4.2014 3) Zvládnutí metodiky kvantitativní real-time PCR na cDNA z MCF-7 buněk. Student se naučí pracovat se SYBR GreenI, základům termálních cyklů, postupům založení a vyhodnocení PCR. Vyzkouší si přípravu agarózových gelů. Termín: 30.1.2014 4) Realizace experimentální části práce Student se bude podílet na přípravě kvantitativní real-time PCR a jejím vyhodnocení u několika vybraných vzorků cDNA. Výsledky zpracuje do bakalářské práce formou: úvod, materiál a metody, výsledky a diskuse s využitím tabulek a grafů. Termíny: experimentální činnost - 30.4.2014, zpracování a interpretace výsledků do bakalářské práce – 15.5.2014 Doporučená literatura: Vybrané kapitoly z knih pojednávajících o PCR a qPCR, kyselině retinové, MCF-7 buňkách, D. rerio, a genové expresi. Přednášky a učební texty o ekotoxikologii, kvalitě a ochraně vod, znečištění způsobené sinicemi. Internetové materiály, knihy a články pojednávající o Wnt/beta kateninové dráze. Odborné články dohledané pomocí databází Web of Science, Science Direct či přímo přes Google. Příklady článků: Fotovati , A., Abu-Al, S., Kage, M., Shirouzu, K., Yamana, H., Kuwano, M. (2011): N-myc Downstream-regulated Gene 1 (NDRG1) a Differentiation Marker of Human Breast Cancer. Pathol. Oncol. Res. 17:525–533. Marchetti, M., Russo, L., Balducci, D., Falanga, A. (2011): All trans-retinoic acid modulates the procoagulant activity of human breast cancer cells. Thrombosis Research 128, 368–374. Při vyhledávání lze doporučit následující klíčová slova: Retinoic acid, MCF-7 cells, gene expression, Cyanobacteria, atd. V Brně dne: 29. října 2013