Volně žijící zvířata často představují nepříliš detailně prozkoumaný, avšak významný rezervoár širokého spektra živočišných virů. Velkým problémem při studiu patogenů volně žijících zvířat je problematická dostupnost vzorků. Díky spolupráci s pracovníky ústavu ochrany lesů a myslivosti Mendelovy univerzity v Brně jsme získali jedinečnou příležitost analyzovat vzorky střevního obsahu kachen divokých. Hlavním cílem práce budou ptačí rotaviry skupin A, D, F a G. Výskyt těchto virů není u divokých kachen prostudován. Rotaviry mají segmentovaný genom tvořený dsRNA, což umožňuje vznik rekombinantů a nových variant viru, které mohou představovat riziko pro hospodářská zvířata i člověka. Viry budou detekovány metodou reverzně transkripční PCR, pro detailní typizace bude využita sekvenační analýza genových segmentů kódujících významné povrchové virové proteiny VP4 a VP7, případně některé další genomové segmenty. Jedná se o velmi aktuální téma, začátek experimentálních prací je od října 2016 v Laboratoři molekulární epidemiologie virových nákaz Oddělení virologie VÚVeL Brno. Laboratoř je zaměřena na studium gastroenterálních patogenů člověka a hospodářsky významných zvířat včetně divoce žijících druhů z čelení Picornaviridae, Reoviridae, Coronaviridae aj. Vyžadujeme ochotu se intenzivně věnovat experimentům. Nabízíme praktické seznámení se s metodami molekulární virologie (zpracování vzorků biologického materiálu, extrakce nukleových kyselin, PCR, reverzně transkripční PCR, PCR v reálném čase, sekvenace) se zaměřením na diagnostiku virů včetně analýzy získaných dat.