Diplomová práce

Automatizovaná analýza epidemiologických charakteristik z dat NZIS

Automated analysis of epidemiological characteristics based on National Health Registries of the Czech Republic

Bc. Petra Kovačovicová
Anotace

Tato diplomová práce se zabývá tvorbou automatizovaného reportu, který obsahuje epidemiologické charakteristiky. Tyto reporty jsou velmi důležité, protože poskytují rychlý a stručný přehled o zvoleném onemocnění a s pomocí epidemiologických charakteristik můžeme získat obraz o zdravotním stavu obyvatelstva. Pokud jsou ukazatele věkově standardizované, je možné porovnávat země z hlediska stavu onemocnění …více

Abstract

This master thesis deals with the generation of an automated report containing epidemiological characteristics. These reports are important as they provide a quick and concise overview of the selected disease and, with the help of epidemiological characteristics, we can get a picture of the population health. When indicators are age standardized, it is possible to compare countries for disease status …více

Klíčová slova
Automatizovaný report Epidemiologie Věková standardizace Joinpoint regrese Střední doba přežití Automated report Epidemiology Age standardization Joinpoint regression Restricted mean survival time
Zadání práce
Data Národního zdravotnického informačního systému (NZIS) jsou celopopulačním zdrojem dat o výskytu onemocnění, zároveň jde o objemná data s potenciálem pro automatizované zpracování. Úkolem studenta je na základě dat NRHOSP (Národní registr hospitalizovaných) a LPZ (listu o prohlídce zemřelého) zalgoritmizovat tvorbu epidemiologických charakteristik relevantních diagnóz a vytvořit nástroj pro jejich automatizované generování.

Úkoly studenta:
1) Provést rešerši dostupné literatury zabývající se využitím administrativních dat pro analýzu epidemiologických charakteristik onemocnění
2) Seznámit se se strukturou dat NRHOSP a LPZ a jejich propojitelností
3) Výbrat klinicky relevantní diagnózy, u nichž je kombinací dat o hospitalizacích a úmrtích možné získat relevantní epidemiologická data
4) Algoritmizovat výpočet epidemiologických charakteristik včetně jejich standardizace
5) Automatizovat generování epidemiologických reportů nad databázemi NRHOSP a LPZ
6) Diskutovat limitace využití administrativních dat pro epidemiologii a provést srovnání s relevantní literaturou

Literatura
Falster MO, Jorm LR, Leyland AH Visualising linked health data to explore health events around preventable hospitalisations in NSW Australia BMJ Open 2016;6:e012031. doi: 10.1136/bmjopen-2016-012031
Hannah Gordon, Ebbe Langholz; The EpiCom Survey Registries Across Europe, Epidemiological Research and Beyond, Journal of Crohn's and Colitis, Volume 11, Issue 8, 1 August 2017, Pages 1019–1021, https://doi.org/10.1093/ecco-jcc/jjx013
Jeger RV , Pfister O , Radovanovic D , Eberli FR , Rickli H , Urban P , Pedrazzini G , Stauffer J-C , Nossen J , Erne P and for the AMIS-Plus Investigators. Heart failure in patients admitted for acute coronary syndromes: A report from a large national registry. Clin Cardiol. 2017;0:1–7. https://doi.org/10.1002/clc.22745
Petra Sedova, Robert D.Brown, Miroslav Zvolsky, Pavla Kadlecova, Tomas Bryndziar, Tomáš Kubelka, Viktor Weiss, Ondřej Volný, Josef Bednarik, Robert Mikulik (2017) Incidence of Hospitalized Stroke in the Czech Republic: The National Registry of Hospitalized Patients. Journal of Stroke and Cerebrovascular Diseases, Volume 26, Issue 5, Pages 979-986.
Theingi Tiffany Win, Herbert T. Davis, and Warren K. Laskey (2016) Mortality Among Patients Hospitalized with Heart Failure and Diabetes Mellitus: Results from the National Inpatient Sample 2000 – 2010. Circ Heart Fail. 2016 May; 9(5): e003023. doi: 10.1161/CIRCHEARTFAILURE.115.003023
Yizhao Ni, Kathleen Alwell, Charles J Moomaw, Daniel Woo, Opeolu Adeoye, Matthew L Flaherty, Simona Ferioli, Jason Mackey, Felipe De Los Rios La Rosa, Sharyl Martini, Pooja Khatri, Jane C Khoury, Dawn Kleindorfer and Brett M Kissela (2017) Abstract 135: Towards Automated Incidence Rate Reporting: Leveraging Machine Learning Technologies to Assist Stroke Adjudication in a Large-scale Epidemiological Study. Stroke. 2017;48:A135.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
11. 5. 2019 18:29, RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D., učo 9787
Plný text práce
2,6 MB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
14. 6. 2019
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D., učo 9787
IBA SpolP LF MU

Oponent

Ing. Milan Blaha, Ph.D., učo 54092
IBA SpolP LF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Experimentální biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.