Závěrečná práce: Marie Jankůjová, učo 423826: Bioinformatická analýza hypobiózy u larev Teladorsagia circumcincta
Bakalářská práce
Bioinformatická analýza hypobiózy u larev Teladorsagia circumcincta
Bioinformatic analysis of hypobiosis in Teladorsagia circumcincta larvae
Anotace
Teladorsagia circumcincta je hlístice parazitující v žaludku domácích i divokých přežvýkavců. Při nepříznivých podmínkách je schopná reagovat stavem hypobiózy. Jedná se o způsob pozastavení vývoje, který může být podobný velmi prozkoumanému stavu dauer larva hlístice Caenorhabditis elegans. Tato práce se zaměřuje na analýzu genové exprese u larev T. circumcincta indukovaných k hypobióze pomocí mikročipové …více
Abstract
Teladorsagia circumcincta is a nematode parasitizing in the stomach of domestic and wild ruminants. Under unfavourable conditions, T. circumcincta is able to respond with hypobiosis. It is a way of arrested development, which can be similar to the very explored dauer larva in C. elegans nematode. This thesis is aimed at gene expression analysis in T. circumcincta larvae induced to hypobiosis with microarray …více
Zadání práce
Teladorsagia circumcincta (Nematoda: Trichostrongylidae) is a nematode parasitizing mallow in wide range of domestic and wild ruminants. In temperate climate it is considered as economically important parasite of sheep and goats, which is one of the originators of the parasitic gastroenteritis.
Hypobiosis is the adaptation phenomenon allowing a parasite to survive periods of adverse environmental conditions in a host, in a anabiosis state. Despite the epizootiological significance of hypobiosis is known for many decades and patterns of detained endogenous development have been described in many parts of the world, the molecular mechanisms of this phenomenon are not yet sufficiently understood. So called dauer larva is much more extensively studied similar adaptation phenomenon, which occurs in saprophytic soil nematode Caenorhabditis elegans. Results of previous studies focused on the study of the suspended development are ambiguous and regulatory mechanisms leading to hypobiosis still remain unclear.
Objectives of the thesis:
- Analyze microarray gene expression data and process the results – hybridization of chip for Caenorhabditis elegans RNA with RNA samples isolated from Teladorsagia circumcinta (microarrays).
- Compare results of gene expression (microarrays) with proteomic data (mass spectrometry) reflecting the protein composition of excretory-secretory products of T. circumcinta.
- Validate and explore in more detail presence of the proteins encoded by the genes daf-7, daf-16, daf-1, daf-4 and daf-2 (involved in the regulation of dauer process signaling cascades in saprophytic nematodes) in T. Circumcinta hypobiotic larvae using bioinformatic methods.
- Carry out a phylogenetic analysis of gene sequences daf-7, daf-16, daf-1, daf-4 and daf-2 in order to detect their genetic variability in related organisms using hypobiosis process.
18. 5. 2016 23:13, Mgr. Jan Oppelt, Ph.D.
Konzultant
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Metody analýzy proteomu ve studiu hormonálních regulací u rostlin
RNDr. Jan Skalák, Ph.D., učo 269813 -
Využití kapilární elektroforézy v kombinaci s hmotnostní spektrometrií v bioanalytické chemii
Mgr. Eliška Cvingráfová, učo 211614 -
Vlastnosti, výskyt a metody stanovení nových typů zpomalovačů hoření v prostředí
Mgr. Zuzana Hochmanová, Ph.D., učo 309573 -
Targeted proteomics, a new approach for protein quantitation in tumor biology
Mgr. Jakub Faktor, Ph.D. -
Studium laserem indukovaného oxidativního značení aminokyselin a peptidů
Mgr. Kristína Piliarová -
Patogeneze, diagnostika a prevence významných virových chorob kapra
Mgr. Bc. Radek Machát, Ph.D., učo 270568 -
Hmotnostní spektrometrie kyseliny retinové
Mgr. et Mgr. Kristína Hajtmanová -
Kapilární elektroforéza s absorpční a MS detekcí pro separaci Se specií
Mgr. Adam Pruška, učo 408946




