Dnešní techniky získávání genomických dat spoléhají na hybridizaci (párování do duplexu) nebo syntézu velkého počtu krátkých řetězců DNA. V tak masivně paralelních technikách dochází často k odchylkám chování jednotlivých molekul od normálu, způsobené známými, či méně známými mechanismy. Pracoviště CMBGT IHOK FN Brno poskytne hybridizační data z mnohokrát opakovaných "microarray" experimetů na standardním vzorku RNA. Seznamte se s principem fungování "microarray" technologie a DNA čipy. Sestrojte výpočetní nástroj, který analyzuje data dvěma způsoby: 1) Sestrojí model očekávaných výsledků pro standardní vzorek (normál). Vyhledá sondy, které sdílejí společné vlastnosti (obsah určité podsekvence, poloha sondy, poloha sekvence v genu, poloha sekvence na chromozomech) a vhodným statistickým testem zjistí, jestli odpovídají modelu (normálu), 2) vyhledá v datech projevy známých procesů (neúplná transkripce, vznik sekundárních struktur, alternativní splicing) a statisticky vyhodnotí jejich vliv naměřené hodnoty exprese.