Bakalářská práce

Evoluce velikost genomu a obsahu DNA bazí v rodě Nepethes

Evolution of genome size and DNA base composition in Nepenthes

Ondřej Knápek, učo 356876
Anotace

Rod Nepenthes je tropickým rodem masožravých rostlin s cca 120 druhy, rostoucími v pralesních a horských oblastech převážně v Indomalajsii. Pestrost stanovišť, ekologie, geografická izolace ostrovů a masožravá strategie výživy, zde umožňuje testovat řadu hypotéz souvisejících s evolucí genomu rostlin za různých podmínek prostředí. Velikost genomu a AT/GC genomový poměr byly změřeny pro 109 vzorků …více

Abstract

Nepenthes is a tropical genus of carnivorous plants comprising about 120 species, growing in rainforest and montane areas of Indomalaysia. The diversity of habitats, ecology, geographical isolation of islands and carnivorous nutrition strategy, allows testing a number of hypotheses related to the evolution of plant genome under various environmental conditions. Genome size and AT / GC genomic ratio …více

Zadání práce
Velikost genomu a obsah GC bazí jsou důležitými genomickými parametry odrážejícími nejrůznější procesy evoluce genomu a podmiňující některé vlastnosti rostlin, které se mhou projevit na jejich morfologii a ekologii. Díky větší energetické náročnosti syntézy většího genomu a s tím souvisejících větších buněčných struktur se očekává, že rostliny limitované dostupností živin budou mít obecně tendenci ke zmenšování genomu a k menší frekvenci tvorby polyploidů. Jedním z exemplárních případů limitace živinami jsou masožravé rostliny, jejichž schopnost masožravosti se vyvinula právě jako adaptace na nedostatek živin v okolním prostředí (Darwin 1875, Givinish/et al./ 1984, Adamec 1997, Ellison 2006). Přesto, že masožravé rostliny jsou ekologicky a morfologicky poměrně výraznou funkčně-ekologickou skupinou (Ellison et Gotelli 2009, Gibson et Waller 2009), diverzita jejích genomů je zatím pouze omezeně známa. Systematičtější data existují dosud jen pro čeleď /Lentibulariaceae/, ve kterých přitom byla odhalen druh s dosud nejmenším rostlinným genomem (Greilhuber et al. 2006). Jako vhodný kandidát na další studium se jeví rod Nepenthes. Ten kromě naprosté absence jakýchkoliv genomických dat představuje i dobrý biogeografický model, umožňující kromě pokračování v hledání rostlin s nejmenším genomem testovat i některé hypotézy týkající se ekologie genomů a genomové změny doprovázející adaptivní radiace.
Práce zkontrolována:
20. 5. 2012 06:53, Mgr. Petr Šmarda, Ph.D., učo 21109
Plný text práce
1,7 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
13. 6. 2012
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Petr Šmarda, Ph.D., učo 21109
ÚBZ Biol PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Ekologická a evoluční biologie
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.