Diplomová práce

Obsah DNA a AT/GC genomový poměr v čeledi Apiaceae

DNA content and AT/GC genomic ratio in the family Apiaceae

Bc. Jana Schwarzová, učo 136124
Anotace

V průběhu evoluce druhů dochází neustále k plynulým či skokovým změnám v jaderných genomech. Výsledkem je dnešní vysoká variabilita v obsahu DNA i jejím složení u krytosemenných rostlin. V předkládané práci byly cytometrickým měřením stanoveny absolutní obsah DNA (2C-value), monoploidní velikost genomu (Cx-value), průměrná velikost chromozomů a poměr AT/GC bazí pro 79 taxonů čeledi Apiaceae a 2 druhy …více

Abstract

During the evolution of the species continuous or jump changes in nuclear genomes constantly occure. These processes lead to high nowaday variability in DNA content and its composition in angiosperms. In this study, absolute DNA content (2C-value), monoploid genome size (Cx-value), average chromosome size and AT/GC genomic ratio was measured using flow cytometry for 79 Apiaceae family taxa and 2 Araliaceae …více

Zadání práce
U dosažitelného počtu českých druhů čeledi stanovit 1. obsah DNA vůči standardu Lycopersicon esculentum (barvením PI na cytometru CyFlow) 2. relativní velikost geonomu témuž standardu (barvením DAPI na cytometru PA 1) 3. z rozdílné barvitelnosti stanovit DF_DAPI faktor (Barow et Meister 2002); pomocí Gödeleho rovnice, DF_DAPI faktoru a frekvence AT u rajčete vypočítat frekvenci AT u sledovaných vzorků. Z každého vzorku zpracovat: 1. herbářový doklad 2. živá rostlina v kelímku nebo v květináči pro cytometrické měření, když bude proveditelné rychle je možné uchovávat zhruba jeden týden v ledničce ve vodě čisté listy (je možné užít i listy ze vzorku na chromosomy) – ve spolupráci s Luckou Horovou Struktura práce: 1. Současné poznatky o vztazích mezi velikostí genomu k ekologickými a geografickými parametry druhů. 2. Význam frekvence AT bazí u organismů z hlediska ekologického. 3. Význam velikosti genomu a AT frekvence z hlediska fylogenetického. 4. Charakteristika modelové čeledi Apiaceae, zejména po stránce karyologické 5. Použité metody 6. Seznam lokalit studovaných vzorků 7. Výsledky studie (analytická část + testy korelace velikosti genomu a obsahu AT bazí, popř. významu genomových parametrů ve vztahu k ekologickým parametrům studovaných druhů) 1) Barow M. et Meister A. 2002. Lack of correlation between AT frequency and genome size in higher plants and the effect of nonrandomness of base sequences on dye binding. Cytometry 47: 1–7. 2) Bennett MD. et Leitch IJ. 2005. Angiosperm DNA C-values database (release 6.0, Oct. 2005) http://www.rbgkew.org.uk/cval/homepage.html 3) Bureš P, Wang Y-F, Horová L. et Suda J. 2004. Genome Size Variation in Central European Species of Cirsium (Com-positae) and their Natural Hybrids. Annals of Botany 94: 353–363. 4) Ellenberg H, Weber HE, Düll R, Wirth V, Werner W, Paulissen D. 1992. Indicator values of plants in Central Europe. Scripta Geobotanica 18: 1–258. 5) Godelle B, Cartier D, Marie D, Brown SC, et Siljak-Yakovlev S. 1993. Heterochromatin study demonstrating the non-linearity of fluorometry useful for calculating genomic base composition. Cytometry 14: 618–626.
Kontrola práce vedoucím nebo pověřenou osobou dosud neprovedena.
Plný text práce
1,7 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
16. 6. 2011
Práce nebyla obhájena

Studentka v rámci svého studia diplomovou práci obhájila 9. 2. 2012.

Vedoucí

prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D., učo 2635
ÚBZ Biol PřF MU

 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.