Bakalářská práce

Velikost genomu a genomový poměr bází v řádech Lamiales, Ericales a Caryophyllales

Genome size and genomic base composition in the orders of Lamiales, Ericales, and Caryophyllales

Jan Furch
Anotace

Hlavním cílem této analytické studie je doplnění genomických údajů zejména u tropických a subtropických druhů z řádů Ericales, Lamiales a Caryophyllales. Pomocí průtokové cytometrie byla změřena velikost genomu a AT/GC genomový poměr bází u 97 taxonů. U většiny z těchto rostlin byla také naměřena délka průduchů a z literatury byla získána dostupná data o počtu jejich chromozomů. Pomocí fylogenetického …více

Abstract

This analytical study primarily enhances new genomic data, focusing on tropical and subtropical species from the orders Ericales, Lamiales, and Caryophyllales. For 97 taxa, genome size, and the AT/GC base-pair ratio were determined using flow cytometry. Additionally, the length of stomatal guard cells was measured for most of these plants, and chromosome number information was extracted from literature …více

Zadání práce
Velikost genomu a genomový poměr bází (GC obsah) jsou druhově specifické, relativně stabilní znaky organizmů, často spojené s jejich ekologií, fyziologií, morfologií nebo geografickou distribucí. Kumulace těchto genomických dat u rostlin intenzivně narůstá zejména v posledních dekádách a nynější znalosti těchto parametrů u krytosemenných pokrývají v případě velikosti genomu ca 5 % druhové diverzity této linie. Hlavními cíli práce je: (i) doplnit tato genomická data zejména u tropických a subtropických zástupců řádů Lamiales, Ericales a Caryophyllales, na základě flow-cytometrického měření rostlinného materiálu získaného z botanických zahrad. (ii) Nově naměřená data integrovat s údaji pro velikosti genomu a GC obsahu (popř. počty chromosomů) excerpovanými z dostupné literatury a databází. (iii) Rekonstruovat evoluci velikosti genomu a GC obsahu v rámci zmíněných řádů. (iv) Znovu otestovat v minulosti analyzovaný vztah mezi velikostí genomu a nezávislým vznikem karnivorie v těchto řádech. (v) Prozkoumat vztah mezi délkou průduchových buněk a genomickými parametry.
Práce zkontrolována:
7. 5. 2024 07:03, prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D., učo 2635
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
13. 6. 2024
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D., učo 2635
BioRos ÚBZ Biol PřF MU

Oponent

Ing. Mgr. Klára Panda, učo 460385
BioRos ÚBZ Biol PřF MU

Konzultanti

Ing. Jakub Šmerda, Ph.D., učo 133653
BioRos ÚBZ Biol PřF MU
Mgr. František Zedek, Ph.D., učo 67595
BioRos ÚBZ Biol PřF MU

Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Plán
Ekologická a evoluční biologie
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.