Bakalářská práce

Testování nových pufrů pro průtokovou cytometrii

Testing of new buffers for flow cytometry

Lucie Elederová
Anotace

V rostlinné průtokové cytometrii je používáno mnoho pufrů lišících se svým chemickým složením. Mnohé z nich však neprošly žádným testováním. Tak je tomu i s pufry Laboratoře průtokové cytometrie Ústavu botaniky a zoologie Masarykovy Univerzity. Tato práce si kladla za cíl otestovat čtyři nové pufry vzniklé v této laboratoři: O-HCl-tween, HCl-tween, HNO3-tween a HCl-triton. Pufry byly testovány ve dvou …více

Abstract

There are a lot of buffers with different chemical compositions used in plant flow cytometry. However, many of them have not been tested. This is also the case with the buffers of the Laboratory of Flow Cytometry of Department of Botany and Zoology, Masaryk University. This work aimed to test four new buffers created in this laboratory: O-HCl-tween, HCl-tween, HNO3-tween, and HCl-triton. The buffers …více

Zadání práce
Oficiální zadání: Sekundární metabolity jsou pro rostliny velmi prospěšné - chrání je před parazity, predátory a nepřízní počasí, zvyšují jejich schopnost konkurence a reprodukce, regulují jejich růst atd. Bohužel, právě sekundární metabolity způsobují největší potíže při přípravě vzorků pro průtokovou cytometrii. Některé rostlinné vzorky jsou ve standardním pufru (OTTO) obtížně měřitelné nebo je jimi stanovená hodnota velmi nespolehlivá. Jednou z možností, jak tento problém vyřešit je použít jiný pufr pro přípravu vzorku. Při potýkání se s problematickými rostlinnými vzorky bylo v Laboratoři průtokové cytometrie Biosystematické skupiny vyvinuto několik nových pufrů. U těchto pufrů však nikdy nebyla testována opakovatelnost a spolehlivost měření. Cíle práce: 1) Testovat vliv pufrů na opakovatelnost měření: srovnání CV hodnot standardů v nových pufrech a v nejrozšířenějším pufru (OTTO I+II); 2) Srovnat vliv nových a běžně používaných pufrů na měřené parametry: především na stanovení velikosti genomu a GC obsahu. Literatura: Loureiro J, Rodriguez E, Dolezel J, Santos C. Comparison of four nuclear isolation buffers for plant DNA flow cytometry. Ann Bot. 2006 Sep;98(3):679-89. Loureiro J, Rodriguez E, Dolezel J, Santos C. Two new nuclear isolation buffers for plant DNA flow cytometry: a test with 37 species. Ann Bot. 2007 Oct;100(4):875-88. Loureiro J, Rodriguez E, Dolezel J, Santos C. Flow cytometric and microscopic analysis of the effect of tannic acid on plant nuclei and estimation of DNA content. Ann Bot. 2006 Sep;98(3):515-27. Doležel, J., Greilhuber, J., Suda, J. (eds.): Flow Cytometry with Plant Cells. Wiley-VCH, Weinheim. 2007
Práce zkontrolována:
25. 5. 2020 10:24, Ing. Jakub Šmerda, Ph.D., učo 133653
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
1. 7. 2020
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Ing. Jakub Šmerda, Ph.D., učo 133653
ÚBZ Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Petr Šmarda, Ph.D., učo 21109
ÚBZ Biol PřF MU

 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Archiv závěrečné práce Lucie Elederová PřF B-CH UCH, UB x89kj/14
10. 2. 2018
Složky
Soubory
Elederová, L.
16. 5. 2020
Elederová, L.
16. 5. 2020
Elederová, L.
16. 5. 2020
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.