Diplomová práce

Evoluce velikosti genomu a genomického GC obsahu u bazálních krytosemenných

Evolution of genome size and genomic GC content in basal angiosperms

Bc. Jan Furch
Anotace

Velikost genomu a genomický obsah GC bází představují klíčové genomické parametry, které jsou reflektovány fyziologií, morfologií a ekologií organismů. U bazálních krytosemenných je však dostupnost těchto údajů stále velmi omezená. Diplomová práce se proto zaměřuje na doplnění genomických dat a morfologických parametrů průduchů u této převážně tropické skupiny krytosemenných rostlin. V rámci práce …více

Abstract

Genome size and genomic GC content represent key genomic parameters that are reflected in the physiology, morphology, and ecology of organisms. However, data availability for these parameters in basal angiosperms remains very limited. This thesis therefore focuses on expanding genomic data and stomatal morphological parameters in this predominantly tropical group of flowering plants. Genome size and …více

Zadání práce
Bazální krytosemenné zahrnují celkem 8 řádů. Většina z jejich druhů patří k tropickým dřevinám často významně zastoupeným v jihovýchodní Asii. Jejich pokrytí znalostmi o velikosti genomu je ve srovnání s temperátními druhy krytosemenných, zejména na severní polokouli, poměrně nízké. Z hlediska genomického obsahu bází (GC obsahu) jsou pak tyto znalosti ještě více mezerovité.
Cílem práce je analýza velikosti genomu a genomického GC obsahu v čeledích řádů Austrobaileyales, Chloranthales, Magnoliales, Laurales, Canellales a Piperales pomocí průtokové cytometrie. Zvláštní pozornost by přitom měla být věnována doplnění těchto genomických dat pro čeleď Annonaceae. Vzorky pro analýzy by měly být získány v rámci spolupráce s kolegy Chen Junhao a Xin Yi z botanické zahrady v Singapuru, případně doplněny o jiné druhy z dalších botanických zahrad. Vedle velikosti genomu a genomického obsahu GC by byly analyzovány (prosvětlovací/odbarvovací metodou) také průduchové parametry (délka svěracích buněk, délka štěrbiny, celková šířka průduchu a hustota průduchů). Pozornost by v rámci cytometrických analýz měla být podle potřeby věnována také případné přítomnosti peaků vyšších ploidních úrovní indikujících přítomnost endopolyploidie.
Osnova: (1) Úvodní část práce – zahrnující obecnou charakteristika strukturních a funkčních vlastností studovaných linií, jejich biogeografie popř. reprodukčních systémů (dvoudomost, hermafroditismus), opadavosti/neopadavosti a životních forem. (2) Metodická část – popisující podrobně zejména použité cytometrické postupy a techniky preparace průduchů. (3) Výsledky – zahrnující (3a) analýzu evoluce genomických parametrů mapovanou na fylogenezi získanou z literatury (min. 80 nově naměřených druhů plus excerpovaná genomická data pro bazální krytosemenné); (3b) vyhodnocení variability velikosti genomu ve vztahu k velikosti svěracích buněk, popř. k dalším strukturním a funkčním vlastnostem studovaných druhů; (3c) analýza vztahu dřevnatosti k velikosti genomu a dalším naměřeným parametrům průduchů; (3d) srovnání velikosti genomu mezi dřevinami bazálních, dvouděložných a jednoděložných rostlin. (4) Diskuse. (5) Závěr.
Práce zkontrolována:
6. 5. 2026 08:16, prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D., učo 2635
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
16. 6. 2026
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D., učo 2635
BioRos ÚBZ Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Pavel Veselý, Ph.D., učo 106706
ÚBZ Biol PřF MU

Konzultant

Mgr. František Zedek, Ph.D., učo 67595
BioRos ÚBZ Biol PřF MU

Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biosystematika rostlin
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.