Závěrečná práce: Bc. Jan Furch: Evoluce velikosti genomu a genomického GC obsahu u bazálních krytosemenných
Diplomová práce
Evoluce velikosti genomu a genomického GC obsahu u bazálních krytosemenných
Evolution of genome size and genomic GC content in basal angiosperms
Anotace
Velikost genomu a genomický obsah GC bází představují klíčové genomické parametry, které jsou reflektovány fyziologií, morfologií a ekologií organismů. U bazálních krytosemenných je však dostupnost těchto údajů stále velmi omezená. Diplomová práce se proto zaměřuje na doplnění genomických dat a morfologických parametrů průduchů u této převážně tropické skupiny krytosemenných rostlin. V rámci práce …více
Abstract
Genome size and genomic GC content represent key genomic parameters that are reflected in the physiology, morphology, and ecology of organisms. However, data availability for these parameters in basal angiosperms remains very limited. This thesis therefore focuses on expanding genomic data and stomatal morphological parameters in this predominantly tropical group of flowering plants. Genome size and …více
Zadání práce
Cílem práce je analýza velikosti genomu a genomického GC obsahu v čeledích řádů Austrobaileyales, Chloranthales, Magnoliales, Laurales, Canellales a Piperales pomocí průtokové cytometrie. Zvláštní pozornost by přitom měla být věnována doplnění těchto genomických dat pro čeleď Annonaceae. Vzorky pro analýzy by měly být získány v rámci spolupráce s kolegy Chen Junhao a Xin Yi z botanické zahrady v Singapuru, případně doplněny o jiné druhy z dalších botanických zahrad. Vedle velikosti genomu a genomického obsahu GC by byly analyzovány (prosvětlovací/odbarvovací metodou) také průduchové parametry (délka svěracích buněk, délka štěrbiny, celková šířka průduchu a hustota průduchů). Pozornost by v rámci cytometrických analýz měla být podle potřeby věnována také případné přítomnosti peaků vyšších ploidních úrovní indikujících přítomnost endopolyploidie.
Osnova: (1) Úvodní část práce – zahrnující obecnou charakteristika strukturních a funkčních vlastností studovaných linií, jejich biogeografie popř. reprodukčních systémů (dvoudomost, hermafroditismus), opadavosti/neopadavosti a životních forem. (2) Metodická část – popisující podrobně zejména použité cytometrické postupy a techniky preparace průduchů. (3) Výsledky – zahrnující (3a) analýzu evoluce genomických parametrů mapovanou na fylogenezi získanou z literatury (min. 80 nově naměřených druhů plus excerpovaná genomická data pro bazální krytosemenné); (3b) vyhodnocení variability velikosti genomu ve vztahu k velikosti svěracích buněk, popř. k dalším strukturním a funkčním vlastnostem studovaných druhů; (3c) analýza vztahu dřevnatosti k velikosti genomu a dalším naměřeným parametrům průduchů; (3d) srovnání velikosti genomu mezi dřevinami bazálních, dvouděložných a jednoděložných rostlin. (4) Diskuse. (5) Závěr.
6. 5. 2026 08:16, prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D., učo 2635
Přílohy
Konzultant
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Velikost genomu a genomový poměr bází v řádech Lamiales, Ericales a Caryophyllales
Mgr. Jan Furch -
Velikost genomu a poměr bazí v genomu čeledi Ranunculaceae
Mgr. Lenka Holubářová -
Evoluce velikosti genomu bazálních linií podčeledi Carduoideae (Asteraceae)
Mgr. Lucie Kozielová -
Testování nových pufrů pro průtokovou cytometrii
Mgr. Lucie Kozielová -
Obsah DNA a AT/GC genomový poměr v čeledi Apiaceae
Mgr. Jana Schwarzová, učo 136124 -
Obsah DNA a AT/GC genomový poměr v čeledi Apiaceae
Mgr. Jana Schwarzová, učo 136124 -
Obsah DNA a AT/GC genomový poměr v čeledi Apiaceae
Mgr. Jana Schwarzová, učo 136124 -
Variabilita velikosti genomu Eleocharis uniglumis subsp. sterneri
Mgr. Jana Kneřová




