Bakalářská práce

Diferenciace a typizace bakteriálních kmenů MALDI-TOF MS hmotnostní spektrometrií

Differentiation and typing of bacterial strains by MALDI-TOF mass spectrometry

David Rakušan
Anotace

Přesná a rychlá bakteriální diagnostika na kmenové úrovni je vzhledem k narůstajícímu výskytu rezistentních kmenů a neustálé hrozbě zneužití patogenních agens pro teroristický útok celospolečensky vysoce žádanou potřebou. Citlivost, rychlost a cenová dostupnost jsou jedny z klíčových nároků pro rutinní využití metody umožnující poddruhovou identifikaci. MALDI-TOF MS se v posledních letech ukázala jako nástroj splňující tyto požadavky.

Abstract

Due to the increasing incidence of resistant strains and the constant threat of abuse of pathogenic agents for terrorist attacks across society, accurate and rapid diagnosis of bacterial strain level is highly desirable need. Sensitivity, speed, and affordability are crucial needs for the routine use methods enabling the identification on the subspecies level. MALDI-TOF MS has recently proved as a tool satisfying these requirements.

Klíčová slova
MALDI-TOF MS bakteriální identifikace bakteriální typizace reprodukovatelnost analýzy příprava vzorku tandemová hmotnostní spektrometrie
Zadání práce
Bakalářská práce bude rešerší na téma aktuálních metodických přístupů využívaných pro MALDI-MS profilování bakteriálních kmenů. Pozornost bude zaměřena na moderní postupy přípravy vzorku a analýzy dat pro odlišování a typizaci bakterií na úrovni kmene. Jedná se především o souhrnný přehled vhodných postupů přípravy vzorku pro analýzu a přístupů k analýze výstupních dat (statistickému hodnocení podobnosti protein/peptidových profilů či vyhledávání specifických biomarkerů). V bakalářské práci budou zmíněny a porovnány nejaktuálnější studie zabývající se diferenciací a typizací bakteriálních kmenů a dále praktické využití diferenciace a typizace kmenů v mikrobiologii, a to zejména klinické (např. kategorizace bakteriálních kmenů dle rezistencí na antibiotika, diferenciace na antibiotika rezistentních kmenů apod.; typizace klinicky významných izolátů podle specifických markerů).
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
17. 5. 2016 11:40, Mgr. Andrea Vávrová, Ph.D.
Plný text práce
1,9 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
9. 6. 2016
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Andrea Vávrová, Ph.D.
ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Experimentální biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.