Diplomová práce

Zkoumání RNA editací pomocí ADAR enzymů

Investigating RNA editing by the ADAR enzymes

Bc. Barbora Nováková
Anotace

Editace adenosinu na inosin pomocí ADAR (RNA adenosin deaminázy) enzymů má důležitou biologickou roli v imunitě a v CNS. Editace může být místně-specifická (hlavně u transkriptů v CNS) nebo nespecifická (hlavně u transkriptů obsahujících Alu elementy). Specifické editace jsou katalyzovány enzymem ADAR2, zatímco nespecifické editace jsou primárně katalyzovány enzymem ADAR1. Mutace v ADAR1, enzymu důležitém …více

Abstract

A-to-I editing by ADAR (adenosine deaminases acting on RNA) enzymes play important biological roles in immunity and in the CNS. Editing can be site-specific (mainly transcripts expressed in the CNS) or promiscuous (mostly transcripts containing Alu elements). Site-specific editing is catalyzed by ADAR2, while the promiscuous editing is primarily catalyzed by ADAR1. Mutations in ADAR1, an enzyme involved …více

Zadání práce
The adenosine deaminase acting on RNA (ADAR) enzymes convert adenosine to inosine in double-stranded (ds)RNA. This RNA modification is known as A-to-I RNA editing. Inosine can be read as guanosine during translation so a different amino acid can be inserted at an edited position in a transcript. This type of RNA editing is catalyzed by ADAR2 and is known as site specific editing or recoding editing. It occurs on transcripts expressed in the central nervous system. In mammals most RNA editing is of transcripts encoding Alu elements. If a transcript encodes Alu elements in reverse orientation to each other, then they can base-pair and form an RNA duplex that can undergo RNA editing. This RNA editing is very important for innate immunity as inosine in transcripts helps the cell to distinguish the transcript as ‘self’ and not a foreign pathogen. ADAR1 is responsible for RNA editing of transcripts encoding Alu elements and if it is inhibited then this triggers an immune response which can lead to cell death. In Drosophila there is only one Adar enzyme that has properties of both mammalian ADAR1 and ADAR2. Drosophila Adar catalyzes site specific RNA editing at more that 1000 position in transcripts mainly expressed in the central nervous system. However, it is also involved in innate immunity in the flies. The project will focus on the regulation and RNA editing by ADAR proteins, both in mammals and in Drosophila. It will investigate whether ubiquitination of mammalian ADAR1 is an important regulatory mechanism for controlling ADAR1. It will also investigate the expression of Drosophila Adar by immunofluorescence.
Práce zkontrolována:
28. 8. 2024 10:12, prof. Mary Anne O'Connell, PhD., učo 236082

Upozornění:

Část závěrečné práce byla v souladu s § 47b zákona o vysokých školách skryta z důvodu překážky pro její zveřejnění do 26. 8. 2027.

Odůvodnění: Zveřejnění částí této závěrečné práce týkající se kapitol Results, Discussion, Conclusions a Appendix je z důvodu ochrany duševního vlastnictví odloženo na dobu 3 let.

Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
9. 9. 2024
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mary Anne O'Connell, PhD., učo 236082
ERAChair CMM CEITEC MU

Oponent

doc. RNDr. Pavel Hyršl, Ph.D., učo 9982
Zivoc ÚEB Biol PřF MU

Konzultant

Liam Keegan, PhD.
ERAChair CMM CEITEC MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.