Bakalářská práce

Metody analýzy genové exprese u Arabidopsis

Methods of gene expression analysis in Arabidopsis

Vojtěch Didi, učo 178854
Anotace

Tato bakalářská práce podává stručné informace o současných možnostech analýzy genové exprese. Jsou zde zmíněny kvalitativní metody používané pro stanovení expresních vzorců, stejně jako metody pro kvantifikaci exprese sledovaných genů se zřetelem na práci s rostlinným genomem. V této práci je také navržen konkrétní postup pro analýzu exprese genů kódujících HPt proteiny (geny pro AHP1-6), které plní …více

Abstract

This Bachelor thesis summarizes and analyzes recent methods used for analysis of gene expression (including quantitative and qualitative methods) especially for work in plants. An approach for expression analysis of genes coding HPt proteins (AHP1-6 genes) is designed. The AHP genes are involved in cytokinin signal transduction in A. thaliana. Understanding of the cytokinin signal transduction …více

Zadání práce
V naší laboratoři se zabýváme studiem role rostlinných hormonů a to zejména cytokininů ve vývoji modelového organizmu Arabidopsis thaliana. Zajímá nás především mechanismus přenosu cytokininového signálu v rostlinné buňce. Recentně bylo zjištěno, že zásadní roli v těchto procesech hrají rostlinné homology bakteriálních, tzv. dvoukomponentních signálních systémů. Tématem této bakalářské práce bude teoretická příprava pro studium analýzy genové exprese a jejich využití při studiu hormonálních regulací u Arabidopsis. Budou analyzovány a popsány metody umožňující analýzu exprese vybraných genů pomocí přípravy stabilních transgenních linií nesoucích gen-zpravodaj („markerový gen“, např. uidA nebo GFP) pod kontrolou genově specifického promotoru, klonování pomocí PCR a „gateway“ a histologická analýza takto připravených linií. Kromě teoretického zvládnutí těchto přístupů bude cílem bakalářské práce navrhnout konkrétní postup pro analýzu exprese genů kódujících HPt proteiny u Arabidopsis (geny AHP1-6), které plní roli předpokládaných přenašečů cytokininového signálu u Arabidopsis. Mezi další metody, které bude možno využít v navazující diplomové práci patří základní i pokročilé techniky mikroskopie (DIC, fluorescenční, konfokální mikroskopie), automatická mikroskopie, in situ lokalizace mRNA i proteinů, (Q) RT PCR atd..
Práce zkontrolována:
11. 10. 2008 13:02, (IS automaticky)
Plný text práce
655,1 KB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
23. 6. 2008
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Eliška Nejedlá, CSc.
ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.