Bakalářská práce

Vizualizace rodokmenu v buněčných populacích

Cell lineage visualization

Antonín Holík
Anotace

Tato práce se zabývá návrhem a implementací webové aplikace na vizualizaci rodokmenů buněčných populací z formátu man_track.txt. Ten je využíván v rámci soutěže Cell Tracking Challenge, ve které se pomocí rodokmenů buněk kontroluje efektivita a přesnost algoritmů zjišťujících informace o buňkách z časosběrných záznamů.

Abstract

This bachelor thesis focuses on design and implementation of web application for lineage visualisation of cell population stored in man_track.txt. This format is used in Cell Tracking Challenge competition in which the effectiveness and accuracy of algorithms for detecting information about cells in time-lapses is found out.

Klíčová slova
Cell Tracking Challenge Centrum analýzy biomedicínského obrazu D3.js dělení buněk rodokmeny buněk vizualizace
Zadání práce
Cílem této bakalářské práce je vytvořit vizualizační nástroj pro interaktivní prozkoumávání rodokmenu v buněčných populacích. Prvním úkolem studenta bude seznámit se s formátem „tracks.txt“ (formát pro archivaci časových sekvencí buněčných populací v mezinárodní soutěži Cell Tracking Challenge), ve kterém je uložena posloupnost předků a potomků a to včetně časových značek jejich vzniku, zániku a mitotického dělení. Dále student navrhne a implementuje vhodný vizualizační nástroj na kompaktní a přehledné interaktivní grafické zobrazení tohoto rodokmenu. Nástroj bude pro implementaci využívat knihovnu D3.js. V textové části se student zaměří na studovanou problematiku a stávající řešení a poté popíše návrh a implementaci vlastního řešení.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
24. 5. 2016 11:22, doc. RNDr. Barbora Kozlíková, Ph.D., učo 60850
Plný text práce
1,6 MB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
22. 6. 2016
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Barbora Kozlíková, Ph.D., učo 60850
KVI FI MU

Oponent

doc. RNDr. Martin Maška, Ph.D., učo 60734
CABO FI MU

Konzultant

doc. RNDr. David Svoboda, Ph.D., učo 2824
CABO FI MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Aplikovaná informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.