Zástupci rodu Enterococcus jsou přirozenou součástí mikroflóry trávícího traktu člověka i mnoha dalších živočichů. Jsou významným infekčním agens podílejícím se na pestré škále humánních infekcí, včetně infekcí nosokomiálních, a proto je většina studií enterokoků zaměřena na druhy a kmeny izolované z klinického materiálu. Mnohem menší pozornost byla doposud věnována enterokokům izolovaným z prostředí, které jsou ve srovnání s klinickým materiálem taxonomicky mnohem bohatší a variabilnější skupinou. Především dynamika výskytu a taxonomická struktura populací enterokoků osídlujících rostliny nebyla doposud uspokojivě popsána. Většina prací zabývajících se touto tématikou byla vypracována před více než deseti lety a neodráží tak současné poznatky o taxonomii tohoto rodu. Cílem této diplomové práce bude izolovat kmeny rodu Enterococcus z rostlin, dále tyto izoláty charakterizovat pomocí molekulárně-biologických a fenotypových metod a identifikovat je v souladu s nejnovějšími změnami v taxonomii tohot rodu. Izolace kmenů bude provedena v průběhu celého vegetačního období, což umožní zhodnocení dynamiky osídlení rostlin enterokoky v čase. Výsledky této diplomové práce by měly přinést nové poznatky o taxonomické variabilitě i o sezónnosti výskytu enterokoků na rostlinách a rozšířit tak naše základní znalosti o ekologii Enterococcus spp.