Diplomová práce

Vliv aktivity mTORC1 na spektrum RNA v exozomech buněk spinocelulárního karcinomu hlavy a krku

Effect of mTORC1 activity on the composition of exosomal RNA in head and neck squamous cell carcinoma

Bc. Šárka Hrachovinová, učo 457465
Anotace

Exozomy jsou malé extracelulární váčky, které hrají důležitou roli v mezibuněčné komunikaci. Z mateřské buňky, ve které vznikly, jsou do extracelulárního prostoru uvolněny exocytózou, obsahují proto proteiny, lipidy i RNA mateřské buňky. Exozomy mohou být přijaty recipientní buňkou a tím mohou ovlivňovat její metabolismus. Vzhledem k tomu, že se exozomy vyskytují ve všech tělních tekutinách, dokážou …více

Abstract

Exosomes are small extracellular vesicles that play an essential role in intercellular communication. They are released into the extracellular space by exocytosis from their cell of origin; therefore, they contain proteins, lipids, and RNA of the parental cell. Exosomes can be taken up by the recipient cell, influencing its metabolism. Since they are found in all body fluids, they can affect the metabolism …více

Zadání práce
Extracelulární vezikuly, například exozomy, představují důležitý způsob mezibuněčné komunikace. U buněk spinocelulárních karcinomů hlavy a krku (HNSCC) představují způsob, jakým nádor ovlivňuje okolní mikroprostředí a imunitní systém ve svůj prospěch, což činí často problém v terapii nádoru (například při radioterapii nebo chemoterapii) [1]. Autofagie je katabolický proces hromadné či selektivní degradace buněčného materiálu (proteinů, organel, buněčných parazitů), nezbytný pro udržování homeostázy v buňce. V nedávné době bylo prokázáno propojení procesů autofagie a buněčné sekrece extracelulárních vezikul. Vzájemná závislost těchto procesů však doposud není objasněna [2]. mTORC1 je hlavním buněčným regulátorem autofagie. Aktivní fosforylovaná forma této kinázy autofagii tlumí, zatímco defosforylovaná forma autofagii stimuluje. Aktivitu komplexu mTORC1 odráží fosforylační status mTOR i jeho cílových proteinů, např. S6K1 nebo 4EBP1 [3]. Vzhledem k tomu, že autofagie slouží jako mechanizmus recyklace odpadního materiálu buňky, může její narušení či naopak stimulace silně ovlivnit složení vylučovaných vezikul, jakožto alternativní způsobu buňky, jak se vypořádat s nechtěným obsahem [4]. Cíle práce: Specifickými modulátory ovlivnit aktivitu mTORC1 (Torin-1, rapamycin, NVP-BEZ235, hladovění). Pomocí fosforylačního statusu specifických proteinů vyhodnotit aktivitu komplexu mTORC1. Izolovat exozomy z buněčných linií HNSCC ovlivněných modulátory mTORC1 pomocí magnetických kuliček se specifickými protilátkami proti exozomálním markerům (CD63, EpCAM) nebo ultracentrifugací. Vyhodnotit složení exozomální RNA pomocí NGS (Next Generation Sequencing).
Práce zkontrolována:
27. 5. 2022 10:27, RNDr. Jan Balvan, Ph.D., učo 141792
Plný text práce
2,3 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
2. 6. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Jan Balvan, Ph.D., učo 141792
VSMM ÚPF Teorie LF MU

Oponent

doc. MUDr. Jaromír Gumulec, Ph.D., učo 185198
ÚPF Teorie LF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.