Modelování rozšíření druhů pomocí statistických metod se stalo hojně využívaným nástrojem v základním i aplikovaném výzkumu biodiverzity. Cílem této bakalářské práce je popsat proces modelování v posloupnosti jednotlivých kroků vedoucích k vytvoření distribučního modelu.
Jedná se o následující kroky:
1) zpracování dat o rozšíření modelovaného taxonu,
2) výběr a zpracování prediktorů jeho výskytu,
3) kalibrace modelu,
4) evaluace modelu
5) predikce vhodnosti prostředí a rozšíření taxonu v novém území nebo v jiném čase.
Hlavní pozornost bude věnována statistickým metodám nejčastěji využívaným pro kalibraci distribučních modelů. Práce podá přehled a kritické zhodnocení nejpoužívanějších metod včetně jejich předpokladů, výhod a úskalí. Práce bude mít koncipována jako návod pro začínající ekology a biogeografy, kteří chtějí tyto metody použít ve svém výzkumu.
Literatura:
Barbet-Massin, M., Jiguet, F., Albert, C. H., & Thuiller, W. (2012). Selecting pseudo-absences for species distribution models: How, where and how many? Methods in Ecology and Evolution, 3(2), 327–338. https://doi.org/10.1111/j.2041-210X.2011.00172.x
Castellanos, A. A., Huntley, J. W., Voelker, G., & Lawing, A. M. (2019). Environmental filtering improves ecological niche models across multiple scales. Methods in Ecology and Evolution, 10(4), 481–492. https://doi.org/10.1111/2041-210X.13142
Elith, J., Phillips, S. J., Hastie, T., Dudík, M., Chee, Y. E., & Yates, C. J. (2011). A statistical explanation of MaxEnt for ecologists. Diversity and Distributions, 17(1), 43–57. https://doi.org/10.1111/j.1472-4642.2010.00725.x
Franklin, J. (2010). Mapping Species Distributions: Spatial Inference and Prediction. Cambridge University Press.
Guisan, A., Thuiller, W., & Zimmermann, N. E. (2017). Habitat Suitability and Distribution Models: With Applications in R. Cambridge University Press.
Mod, H. K., Scherrer, D., Luoto, M., & Guisan, A. (2016). What we use is not what we know: Environmental predictors in plant distribution models. Journal of Vegetation Science, 27(6), 1308–1322. https://doi.org/10.1111/jvs.12444
Petitpierre, B., Broennimann, O., Kueffer, C., Daehler, C., & Guisan, A. (2017). Selecting predictors to maximize the transferability of species distribution models: Lessons from cross-continental plant invasions. Global Ecology and Biogeography, 26(3), 275–287. https://doi.org/10.1111/geb.12530