Závěrečná práce: Martin Gajarský: Sledování rozsahu filtrace fMRI dat pomocí data-driven signálů
Bakalářská práce
Sledování rozsahu filtrace fMRI dat pomocí data-driven signálů
Observing the extent of fMRI data filtration with usage of data-driven signals
Anotace
V této bakalářské práci se věnujeme sledování rozsahu filtrace fMRI dat pomocí data-driven signálů. V teoretické části jsme popsali základní principy zobrazování pomocí funkční magnetické rezonance a uvedli stručné informace o anatomii a fyziologii mozku. Dále jsme vysvětlili vliv fyziologického šumu na fMRI data a vysvětlili důležitost jeho filtrace. V praktické části byla použita data od 20 zdravých …více
Abstract
In this thesis, we study the extent of fMRI data filtration with usage of data-driven signals. In the theoretical section, we described basic principles of functional magnetic resonance imaging and stated brief information about brain anatomy and physiology. Furthermore, we explained the impact of physiological noise on fMRI data and explained the importance of its filtration. In the practical part …více
Zadání práce
- Proveďte literární rešerši a prostudujte základní literaturu v oblasti charakteru šumu a projevu fyziologických artefaktů ve fMRI datech.
- Seznamte se se základními postupy zpracování fMRI dat a ovládáním softwaru SPM.
- Prakticky se seznamte se základní manipulací a aplikací data-driven signálů využívaných při analýze fMRI dat. Zde půjde o signály z různých míst bílé hmoty, mozkomíšního moku a globální signál.
- Vytvořte obrazové mapy ukazující míru a charakter projevu (např. procentuální zastoupení arteficielního průběhu v celkové variabilitě dat). Sledujte vliv volby souřadnic pro extrakci signálů na míru a charakter vysvětlené variability.
- Proveďte diskusi získaných výsledků.
- HUETTEL, S. A., SONG, A. W., MCCARTHY, G. Functional Magnetic Resonance Imaging. 2nd edition. Sunderland: Sinauer Associates, Inc, 2009, p. 542, ISBN 9780878932863.
- WEISSENBACHER, A., KASESS, Ch., GERSTL, F., LANZENBERGER, R., MOSER, E., WINDISCHBERGER, Ch. Correlations and anticorrelations in resting-state functional connectivity MRI: A quantitative comparison of preprocessing strategies, NeuroImage 2009, 47(4):1408-1416
30. 5. 2014 09:25, Ing. Marek Bartoň, Ph.D.
- Zadáno/změněno 24. 6. 2014 09:44, Irena Mitášová
- Záznam založen 18. 2. 2014 09:55, Irena Mitášová
- Zveřejnit od 26. 5. 2014 11:01, Irena Mitášová
- Práce převzata 26. 5. 2014 11:01, Irena Mitášová
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Optimalizace metod zpracování fMRI dat pro zvýšení validity analýz konektivity
Ing. Marek Bartoň, Ph.D. -
Statistické metody segmentace v MRI obrazech mozku
RNDr. Eva Koriťáková, Ph.D., učo 184380 -
Vliv pohybových artefaktů na kvalitu fMRI dat
Mgr. Vít Doležal, učo 171929 -
Metody odhadu NAIRU a jejich robustnost
Ing. Ondřej Divina -
Optimization of fast fMRI acquisition methods and data processing pipelines in neuroscience research
Ing. Anežka Kovářová, Ph.D., učo 423661 -
Persistentní homologie ve výpočetní topologii
Mgr. Peter Synak -
Studium exosomálních mikroRNA u pacientů s gliomy a jejich potenciální využití jako méně invazivních diagnostických biomarkerů
Mgr. Tereza Vaňková, učo 509263 -
Rozpoznávání vizuálních podnětů z obrazových dat funkční magnetické rezonance
Mgr. Matyáš Kuhn




