Bakalářská práce

Charakterizace histonových variant H2A.Z v procesu obranného primingu

Characterization of histone variants H2A.Z in the process of defense priming

Jaroslav Perdoch
Anotace

Regulace eukaryotického chromatinu závisí na interakci mezi mnoha epigenetickými faktory, včetně histonových modifikací, DNA metylací a inkorporací histonových variant. Jedním z příkladů inkorporace histonové varianty je nahrazení kanonického histonu H2A histonovou variantou H2A.Z. Již dříve bylo prokázáno, že histon H2A.Z má důležitou roli při transkripci. Nejen díky této roli, má inkorporace H2A …více

Abstract

The regulation of eukaryotic chromatin depends on the interactions between many epigenetic factors, including histone modifications, DNA methylation and the incorporation of histone variants. One example of histone variant incorporation is the replacement of canonical histone H2A with the histone variant H2A.Z. Histone H2A.Z has previously been shown to play an important role in transcription. Not …více

Klíčová slova
Agrobacterium tumefaciens Arabidopsis thaliana histon H2A.Z Nicotiana benthamiana posttranslační modifikace histone H2A.Z post-translational modifications
Zadání práce

Některé chemické látky způsobují tzv. obranný priming, který je charakterizován rychlejší a efektivnější reakcí rostliny na patogeny, a má tedy velký potenciál v rámci udržitelného zemědělství. Během tohoto procesu dochází vlivem začlenění histonových variant a posttranslačních modifikací (PTMs) histonů k remodelaci struktury chromatinu spojené s rychlým a cíleným přeprogramováním transkriptomu. Jednou z nejvíce efektivních chemických látek spouštějících obranný priming je kyselina beta-aminomáselná (BABA). V rámci navrhovaného projektu vytvoříme transgenní linie rostlin Arabidopsis obsahující značené verze histonové varianty H2A.Z, u které byl prokázaný vztah s transkripčně aktivním stavem genů v rámci reakcí rostliny na okolí. Následně budeme sledovat PTMs jednotlivých histonů v rámci remodelace chromatinu spojené s procesem obranného primingu indukovaného BABA.

Cíle práce:

  • Naklonovat geny pro histon H2A.Z fůzované se SPOT-tag sekvencí do Gateway vektoru pGWB1.
  • Provést pomocí agrobakteria transformaci rostlin A. thaliana (col-0 a ibm1).
  • Ověřit expresi transformovaných genů v rostlinách A. thaliana.
  • Provést pilotní experiment zaměřený na izolaci značených histonů H2A.Z a detekci PTMs.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
20. 5. 2022 08:04, doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D., učo 13418
Plný text práce
2,3 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
20. 6. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D., učo 13418
ÚBioch Chem PřF MU

Oponent

Mgr. Tomáš Brom, Ph.D., učo 436685
NCBR PřF MU

Konzultanti

Mgr. Adam Janotík, Ph.D.
ÚBioch Chem PřF MU
Mgr. Martina Zapletalová, Ph.D., učo 357594
ÚBioch Chem PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Aplikovaná biochemie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.