Závěrečná práce: RNDr. Petr Medek, učo 39593: Computation of channels in protein molecules
Disertační práce
Computation of channels in protein molecules
Anotace
Dlouhodobý biochemický výzkum vlastností molekul proteinů vedl ke zjištění, že schopnost proteinu reagovat se svým okolím úzce souvisí s existencí dutin spojujících důležitou část uvnitř proteinu (aktivní místo) s povrchem proteinu. Tato dizertační práci představuje algoritmus pro geometrickou analýzu takovýchto dutin, zvaných tunely. Ve srovnání s ostatními metodami pro počítaní tunelů je navržený …více
Abstract
Long-term biochemical research into the properties of protein molecules indicated that the reactivity of a protein is closely related to the existence of cavities connecting an important part inside the protein, the active site, with the surface of the molecule. This thesis presents an algorithm for geometrical analysis of such cavities, called channels. In comparison with other approaches to the channel …více
11. 2. 2010 07:20, prof. Ing. Jiří Sochor, CSc.
Vedoucí
KVI FI MU
Oponenti
ZČU Plzeň
Ústav geoniky AV ČR, Ostrava
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Algorithms for Detecting Pathways in Large Protein Structures and Their Ensembles
RNDr. Ondřej Strnad, Ph.D. -
Detection of pathways in large macromolecular structures
RNDr. Ondřej Strnad, Ph.D. -
Algorithms for analysis and comparison of tunnels in protein structures
RNDr. Jan Byška, Ph.D., učo 207879 -
Geometry-based Methods for Detection of Asymmetric Tunnels in Proteins
RNDr. Adam Jurčík, Ph.D. -
Studium vztahů mezi přístupovými cestami a aktivitou enzymů metodami molekulového modelování
Mgr. Ondřej Vávra, Ph.D., učo 393643 -
Predicting supramolecular Interactions and Properties of Systems by Methods of Computational Chemistry
Mgr. Matúš Durec, Ph.D. -
Visualization and Analysis of Large-scale Dynamic Biochemical Data
Mgr. Vilém Šustr, učo 140485 -
Development of geometrical methods for protein engineering and analysis of protein structures
RNDr. Antonín Pavelka, Ph.D.




