Rigorózní práce

Algorithms for analysis and comparison of tunnels in protein structures

Mgr. Jan Byška, učo 207879
Anotace

Když mluvíme o snaze pochopit funkci proteinů, jedná se především o analýzu volného prostoru uvnitř těchto molekul. Volný prostor uvnitř proteinu můžeme rozdělit do několika skupin podle jeho tvaru, umístění a účelu. V mém výzkumu se zaměřuji především na detekci a analýzu takzvaných proteinových tunelů. Tyto tunely slouží jako přístupové cesty k chemicky aktivním místům uvnitř proteinu a proto jejich …více

Abstract

Understanding proteins means mainly the analysis their inner voids. These voids can be classified according to their shape, location and purpose. In my research I focus on the detection and analysis of specific inner structures called tunnels in proteins. These tunnels serve as the transportation pathways for small molecules of ligands to the chemicaly active sites within the protein, and therefore …více

Klíčová slova
protein proteins proteiny protein tunnel proteinový tunel asymmetric tunnel asymetrický tunel volume graphics objemová grafika voxels voxely molecular dynamics molekulární dynamika chemical properties chemické vlastnosti path planning plánování pohybu voronoi diagram voroného diagram
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
10. 4. 2014 08:34, prof. Ing. Jiří Sochor, CSc.
Plný text práce
19,9 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
27. 5. 2014
Práce byla úspěšně obhájena

Oponenti

doc. RNDr. Pavel Matula, Ph.D., učo 2927
KVI FI MU
doc. Ing. Jaroslav Křivánek, Ph.D.
KSVI MFF UK v Praze
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.