Disertační práce

Multiscale simulations of protein-protein interactions

Mgr. Miroslav Jurásek, učo 324029
Anotace

Tato dizertační práce se zabývá studiem protein-membrána a protein-protein interakcí za použítí modelů s různou úrovní zhrubení pomocí metod molekulové dynamiky a Monte Carlo simulací. V práci je použita celá řada modelů od vysoce zhrubených modelů, kde je celý protein aproximován jednou částicí s povrchovou interakcí, až po atomární modely. Použítí modelů s různým rozlišením nám tak umožňilo studovat …více

Abstract

In this dissertation thesis, we studied protein-membrane and protein-protein interactions in models with different levels of coarse-graining via methods of molecular dynamics and Monte Carlo simulations. We employed variety of models ranging from highly coarse-grained ones, where the whole protein is approximated by a single patchy particle, to atomistic models. The use of models with different resolution …více

Klíčová slova
Simulace Molekulová dynamika Monte Carlo Proteiny Lipidové membrány DivIVA protein Dishevelled protein Wnt signální dráha PDZ doména Samouspořádané systémy Simulations Molecular dynamics Proteins Lipid membranes Wnt signaling pathway PDZ domain Self-assembled systems
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
24. 9. 2020 08:13, prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936
Plný text práce
53,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
13. 1. 2021
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936
ÚFKL Fyz PřF MU

Oponenti

prof. Dr. hab. Lukasz Cwiklik, Ph.D.
Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR
RNDr. Mgr. Jan Heyda, Ph.D.
VŠCHT v Praze
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biofyzika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.